恶意短信费用一般由发送恶意短信的一方承担，但具体承担情况需根据实际情况判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、从合同关系角度
与运营商的合同关系：
- 你与手机运营商之间存在服务合同关系，运营商按照约定为你提供通信服务，你支付相应的费用。
- 如果恶意短信并非你主动发送，而是由于他人盗用你的手机号码或利用技术手段伪造你的号码发送，那么这部分费用不应由你承担。因为运营商有义务保障其服务的安全性，防止他人非法使用你的号码。
- 在这种情况下，你可以向运营商提出异议，要求运营商调查并免除这部分费用。如果运营商拒绝，你可以考虑通过法律途径维护自己的权益。
与恶意短信发送者的关系：
- 恶意短信发送者与你之间并没有直接的合同关系，但其行为侵犯了你的合法权益（如隐私权、名誉权等），并可能导致你产生额外的费用（如短信费用）。
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，侵权人应当承担侵权责任，包括赔偿因侵权行为给你造成的损失。因此，如果恶意短信发送者被确认，你有权要求其承担这部分费用。
二、从实际案例角度
- 在实际生活中，如果手机用户收到大量恶意短信，导致短信费用异常增加，用户通常会首先联系运营商进行投诉和查询。
- 运营商在调查后，如果确认是他人盗用或伪造号码发送，一般会免除用户的这部分费用。
- 如果运营商无法确认或拒绝免除费用，用户可以通过法律途径（如起诉恶意短信发送者或运营商）来维护自己的权益。
三、从法律建议角度
保留证据：
- 如果你收到恶意短信并产生额外费用，务必保留好相关证据，如短信记录、费用清单等。这些证据将有助于你后续维权。
及时投诉：
- 第一时间向运营商投诉，要求运营商调查并处理。同时，也可以向当地通信管理局或消费者协会等部门投诉，寻求帮助。
考虑法律途径：
- 如果运营商无法解决问题或拒绝免除费用，你可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。可以咨询专业律师（如我），了解具体的法律程序和维权策略。
总结来说，恶意短信费用一般应由发送恶意短信的一方承担。但在实际操作中，需要根据具体情况来判断和维权。如果你遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。