在棚改过程中，政府内部注销原房产证时，并不一定会直接提交拆迁协议，但两者在流程上存在紧密的关联性。以下是对这一问题的详细分析：

1. 注销房产证与拆迁协议的关系：

   • 注销房产证是房屋拆迁流程中的一个重要环节，它标志着原房屋产权的终止。这一行为通常基于拆迁决定、补偿协议等法律文件，是拆迁实施的前提条件之一。
   • 拆迁协议则是拆迁双方（即政府或开发商与被拆迁人）就拆迁补偿、安置等事项达成的书面协议。它是拆迁过程中保障被拆迁人权益的重要法律文件。
   • 在实际操作中，注销房产证并不直接依赖于拆迁协议的提交，但拆迁协议的内容（如补偿方式、金额、安置地点等）往往会影响房产证的注销流程。例如，在补偿到位且被拆迁人同意的情况下，相关部门才会办理房产证的注销手续。

2. 政府内部注销房产证的流程：

   • 政府或相关部门在收到拆迁决定、补偿协议等法律文件后，会启动房产证的注销程序。
   • 注销程序通常包括审核拆迁文件、核实房屋信息、公告注销事项等步骤。
   • 在注销过程中，相关部门可能会要求被拆迁人提供拆迁协议作为证明文件之一，以确认拆迁的合法性和补偿的到位情况。但这并不意味着拆迁协议必须直接提交给注销房产证的部门，而是可能在整个拆迁流程中作为多个环节的共同依据。

3. 拆迁协议的“链接”作用：

   • 虽然注销房产证时不一定直接提交拆迁协议，但拆迁协议在整个拆迁流程中起着“链接”和“证明”的作用。
   • 它连接了拆迁决定、补偿安置、房产证注销等多个环节，是确保拆迁过程合法、有序进行的重要法律文件。
   • 在后续的法律纠纷或行政复议中，拆迁协议也是证明拆迁双方权益、解决争议的关键证据。

4. 实际操作中的建议：

   • 对于被拆迁人而言，应妥善保管拆迁协议等法律文件，以备不时之需。
   • 在注销房产证前，应确认拆迁补偿已到位且双方无争议，以避免因补偿问题导致的房产证注销受阻。
   • 如对注销房产证或拆迁协议有任何疑问或争议，应及时咨询专业律师或相关部门，以维护自身合法权益。

总结来说，虽然政府内部注销原房产证时不一定直接提交拆迁协议，但拆迁协议在整个拆迁流程中起着至关重要的作用。它不仅是拆迁双方权益的保障，也是注销房产证等后续环节的重要依据。因此，被拆迁人应高度重视拆迁协议的签订和保管工作。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。