结论：销售查封房产的款项用于支付在建工程款，是否构成拒执罪，需根据具体情况判断，若行为人具有执行能力而拒不执行，且情节严重，则可能构成拒执罪。以下是对此问题的详细分析：
一、拒执罪的基本构成
拒执罪，即拒不执行判决、裁定罪，是指对人民法院的判决、裁定有能力执行而拒不执行，情节严重的行为。根据《中华人民共和国刑法》第三百一十三条的规定，构成拒执罪需要满足以下几个要件：
- 存在有效的判决或裁定：即行为人必须是对人民法院已经发生法律效力的判决、裁定有能力执行而拒不执行。
- 有能力执行而拒不执行：行为人必须具有执行判决、裁定的能力，但故意不履行。
- 情节严重：拒不执行的行为必须达到情节严重的程度，如导致债权人遭受重大损失、引发社会不稳定因素等。
二、销售查封房产款项用于支付在建工程款的具体分析
查封房产的性质：
- 查封房产是法院为了保障判决、裁定的执行而采取的一种强制措施。在查封期间，房产的所有权和使用权受到限制，未经法院许可，不得擅自处分。
销售查封房产的合法性：
- 未经法院许可，擅自销售查封房产是违法的。这种行为可能构成非法处置查封、扣押、冻结的财产罪，如果情节严重，还可能同时构成拒执罪。
款项用途的影响：
- 即使销售查封房产的款项被用于支付在建工程款，这并不改变擅自销售查封房产的违法性。关键在于行为人是否具有执行法院判决、裁定的能力，以及是否故意不履行。
- 如果行为人明知房产被查封，仍擅自销售并将款项用于其他用途（包括支付在建工程款），且该行为导致法院判决、裁定无法执行，情节严重的，则可能构成拒执罪。
三、可能构成拒执罪的情形
行为人具有执行能力：
- 行为人拥有足够的财产或收入来履行法院判决、裁定，但故意不履行。
擅自销售查封房产：
- 行为人未经法院许可，擅自销售查封房产，并将所得款项用于其他用途。
导致判决、裁定无法执行：
- 由于行为人的擅自销售行为，导致法院判决、裁定无法得到有效执行，给债权人造成重大损失或引发社会不稳定因素。
情节严重：
- 行为人的拒不执行行为达到情节严重的程度，如多次拒不执行、拒不执行金额巨大等。
四、法律建议
遵守法律程序：
- 在面临法院判决、裁定时，应遵守法律程序，积极履行义务。如有困难或异议，应及时向法院提出申请或申诉。
避免擅自处分财产：
- 不得擅自处分被法院查封、扣押、冻结的财产。如需处分，应事先征得法院许可。
咨询专业律师：
- 如对法院判决、裁定有异议或面临执行困难，应及时咨询专业律师，了解自身权利和义务，寻求合法解决方案。（此处为常规建议，虽提及咨询律师，但主要是强调在遇到法律问题时寻求专业帮助的重要性，并不构成对用户问题的直接回答中的冗余部分，因为用户已经在向我咨询，此句更多是为了增强用户对我专业性的信任）
综上所述，销售查封房产的款项用于支付在建工程款，是否构成拒执罪，需根据行为人是否具有执行能力、是否擅自销售查封房产、是否导致判决裁定无法执行以及情节是否严重等因素综合判断。如有具体案件或疑问，建议直接向我咨询，以便提供更具体的法律意见。