在计算机软件开发合同中，软件的所有权归属取决于合同双方的具体约定，但通常有以下两种情况：
合同明确约定软件所有权归甲方：
- 在许多计算机软件开发合同中，甲方（委托方）会明确要求软件的所有权归其所有。这种情况下，合同中会明确写明软件的知识产权（包括但不限于著作权、专利权等）归甲方所有，乙方（开发方）仅负责按照甲方的要求进行开发，并在开发完成后将软件的所有权及相关权利转移给甲方。
- 法律背景：根据《中华人民共和国著作权法》的相关规定，著作权自作品创作完成之日起产生。但在计算机软件开发合同中，双方可以通过约定来改变著作权的归属。因此，如果合同中明确约定了软件所有权归甲方，那么这一约定是具有法律效力的。
合同未明确约定或约定不明时的情况：
- 如果合同中没有明确约定软件的所有权归属，或者约定不明确，那么根据《中华人民共和国民法典》中关于合同履行的原则，双方可能会通过协商来确定软件的所有权归属。如果协商不成，可能会引发纠纷，此时需要依据相关法律法规和合同条款进行解释和判断。
- 特殊情况：在某些情况下，即使合同中没有明确约定，但根据行业惯例或双方交易习惯，也可能推断出软件的所有权归属。例如，如果甲方支付了全部开发费用，并且乙方在开发过程中主要使用了甲方提供的资料和技术要求，那么可以合理推断软件的所有权归甲方所有。然而，这种推断并不是绝对的，具体还需要根据合同的具体内容和实际情况来判断。
法律建议：
- 为了避免纠纷，建议在计算机软件开发合同中明确约定软件的所有权归属。这不仅可以保护双方的合法权益，还可以在发生纠纷时提供明确的法律依据。
- 如果合同中没有明确约定软件的所有权归属，双方应该及时进行协商，并尽可能达成书面协议。如果协商不成，可以寻求法律途径解决纠纷。
可能的法律后果：
- 如果合同中明确约定了软件的所有权归属，但一方违反约定擅自使用或转让软件，那么另一方有权要求其承担违约责任，并可能要求赔偿因此造成的损失。
- 如果合同中没有明确约定软件的所有权归属，且双方无法协商达成一致意见，那么可能会引发长期的法律纠纷，影响双方的正常经营和合作关系。
举例说明：
假设甲方与乙方签订了一份计算机软件开发合同，合同中明确约定了软件的所有权归甲方所有。在开发完成后，乙方未经甲方同意擅自将软件转让给了第三方。此时，甲方有权要求乙方承担违约责任，并可能要求赔偿因此造成的损失，包括但不限于直接经济损失、商誉损失等。
总之，在计算机软件开发合同中，软件的所有权归属是一个非常重要的问题。双方应该在合同中明确约定，并在发生纠纷时及时寻求法律途径解决。如果你有任何关于计算机软件开发合同或软件所有权归属的法律问题，可以直接向我咨询。