结论：网贷逾期合同中写明可由甲方或者乙方所在地法院起诉，这样的管辖权约定通常是明确的，但具体是否有效及适用还需结合相关法律规定和案件具体情况来判断。
分析说明：
合同约定的效力：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。
- 在您提到的网贷逾期合同中，双方约定可由甲方或者乙方所在地法院起诉，这属于双方对管辖法院的明确约定，且该约定不违反级别管辖和专属管辖的规定，因此，从合同约定的角度来看，管辖权是明确的。
约定管辖的适用条件：
- 尽管合同中有明确的管辖约定，但在实际适用时，还需考虑该约定是否符合法律规定的条件。例如，双方约定的管辖法院必须与争议有实际联系，且不得违反级别管辖和专属管辖的规定。
- 在网贷逾期合同中，甲方和乙方作为合同的双方，其所在地法院与争议有实际联系，因此该约定符合法律规定的条件。
可能存在的争议点：
- 尽管合同中有明确的管辖约定，但在实际诉讼中，仍可能因各种原因产生争议。例如，一方可能主张合同中的管辖约定存在欺诈、胁迫等情形，要求撤销该约定；或者双方对“甲方所在地”或“乙方所在地”的具体理解存在分歧。
- 在这些情况下，法院将根据相关法律规定和案件具体情况，对管辖约定的效力进行审查，并作出相应的判决。
法律建议：
- 对于网贷借款人：在签订网贷合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于管辖权的约定。如果认为合同中的管辖约定不合理或存在风险，可以与出借人协商修改或寻求法律帮助。
- 对于网贷出借人：在制定网贷合同时，应明确约定管辖法院，并确保该约定符合法律规定和案件实际情况。同时，在出借资金前，应对借款人的信用状况和还款能力进行充分评估，以降低逾期风险。
- 在发生争议时：双方应首先尝试通过协商、调解等方式解决争议。如果协商、调解无果，且合同中有明确的管辖约定，则应按照约定向有管辖权的人民法院提起诉讼。
后续行动指南：
- 如果您是网贷借款人或出借人，且因逾期问题产生争议，建议首先查阅合同中的管辖约定，并了解相关法律规定。
- 如果对管辖约定或法律规定存在疑问或不解，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律解释和建议。
- 在提起诉讼前，建议收集并整理好相关证据材料，以便在诉讼中更好地维护自己的合法权益。