境内自然人直接投资境外公司，若未按照相关规定办理外汇登记等手续，可能构成违法，需承担相应的法律责任，具体责任类型及后果需根据违法情节的严重程度来判断。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律责任类型

1. 行政责任

   • 外汇管理违规：根据《中华人民共和国外汇管理条例》等相关规定，境内自然人未经批准擅自将境内资产转移至境外进行投资，或者未按照规定办理外汇登记等手续，外汇管理机关有权责令改正，给予警告，并可以处以罚款。罚款的数额根据违法情节的严重程度而定，可能涉及违法所得的一定比例或者固定金额。
   • 税务违规：如果境内自然人在境外投资获得收益后，未按照规定申报并缴纳税款，还可能面临税务机关的处罚，包括补缴税款、加收滞纳金以及罚款等。

2. 刑事责任

   • 在极端情况下，如果境内自然人的境外投资行为涉及非法集资、诈骗等犯罪活动，或者严重违反国家外汇管理规定，情节特别严重，可能构成犯罪，需要承担刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，可能涉及的罪名包括非法经营罪、逃汇罪等，具体刑罚根据犯罪情节的严重程度而定，可能包括有期徒刑、罚金等。

二、违法情节与法律责任的关系

1. 违法情节轻微：如果境内自然人的境外投资行为虽然未按照规定办理相关手续，但情节轻微，未造成严重后果，外汇管理机关或税务机关可能仅给予警告或处以较轻的罚款，而不会追究刑事责任。

2. 违法情节严重：如果境内自然人的境外投资行为涉及大量资金、多次违规或者造成严重后果，如导致国家外汇流失、损害国家利益等，外汇管理机关或税务机关将依法给予较重的处罚，并可能移送司法机关追究刑事责任。

三、法律建议

1. 合规投资：境内自然人在进行境外投资时，应严格遵守国家外汇管理、税务等相关法律法规的规定，办理必要的审批和登记手续，确保投资行为的合法性。

2. 咨询专业意见：由于境外投资涉及复杂的法律、税务和外汇等问题，建议境内自然人在进行投资前咨询专业的律师或财务顾问的意见，以降低法律风险。

3. 及时整改：如果境内自然人已经存在违规投资行为，应尽快与相关部门沟通并整改，以避免更严重的法律后果。

举例说明：假设某境内自然人未经批准擅自将100万元人民币转移至境外进行投资，且未按照规定办理外汇登记手续。外汇管理机关在发现后，可能责令其改正，并给予警告，同时处以违法所得（即100万元）一定比例的罚款，如5%至10%不等。如果该自然人拒不改正或者情节严重，外汇管理机关还可能将其移送司法机关追究刑事责任。

总之，境内自然人直接投资境外公司需严格遵守相关法律法规的规定，否则可能面临行政责任甚至刑事责任。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。