农村土地“红本子”（即农村土地承包经营权证）丢失后，可按照以下步骤处理：

1. 及时挂失并公告声明作废
   发现证书丢失后，应第一时间向发证机关（通常是乡镇人民政府或县级农业农村主管部门）报告挂失，并在当地村委会或乡镇政府公告栏发布书面声明，说明原证书作废。此举可防止他人冒用证书进行非法活动，同时为后续补办程序提供依据。

2. 准备补办申请材料
   向发证机关提交书面补办申请，并附以下材料：

   • 申请人身份证明（身份证、户口簿等）；
     
   • 土地承包合同（若合同也丢失，需提供村委会或集体经济组织出具的承包关系证明）；
     
   • 挂失公告的证明材料（如公告照片、村委会盖章的公告记录等）；
     
   • 土地权属来源证明（如原颁证档案、分地记录等，可向村委会或乡镇档案室调取）。
     

3. 发证机关审核与补发
   发证机关会对申请材料进行审核，必要时会实地核查土地现状。审核通过后，会重新颁发农村土地承包经营权证，并在证书上注明“补发”字样。补发程序通常需15-30个工作日，具体时限以当地规定为准。

注意事项：

• 若原证书因灭失（如火灾、水灾）丢失，需在申请中说明灭失原因，并附相关证明（如消防部门出具的火灾证明）；
  
• 补办期间，原证书的法律效力终止，但土地承包关系不受影响；
  
• 若涉及土地流转或抵押，需在补办后及时办理变更登记，确保权益不受损。
  

法律依据：
根据《农村土地承包经营权证管理办法》第十七条，承包方有权依法申请补发农村土地承包经营权证，发证机关应按程序办理。若因发证机关过错导致证书丢失，承包方可要求其承担相应责任。

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