抚养费和医疗费在协议中是可以分开写的，这样的安排有助于明确双方的责任划分，更好地保障子女的权益，同时也能减少后续可能出现的纠纷。以下是对这一问题的详细解答：
一、为何需要分开约定？
费用性质不同：
- 抚养费（生活费）：主要覆盖子女的日常衣食住行等基本需求，是定期且相对稳定的支出。
- 医疗费：属于大额、非定期支出，可能因子女健康状况的变化而波动较大。
避免纠纷：
- 明确各自承担的范围，可以减少后续因费用性质不明确而产生的争议，例如私立学校学费是否应计入抚养费等。
灵活调整：
- 分开约定可以使得双方在面对经济变化或实际需求变化时，更灵活地协商变更单项费用的标准。
二、协议撰写要点
抚养费条款：
- 金额与支付方式：明确每月或每年支付的抚养费金额，以及支付方式和时间。
- 调整机制：可以约定根据物价指数上涨、子女成长需求变化等因素，适时调整抚养费标准。
- 用途限制：可以约定抚养费仅用于子女日常生活开支，不得挪作他用。
医疗费用条款：
- 常规医疗：明确日常门诊、药品等费用的承担方式和结算周期。
- 重大疾病：约定单次治疗费用超过一定金额时，双方的分担比例和支付方式。
- 保险覆盖：鼓励为子女购买商业医疗保险，并约定保费的分担方式。
三、示例条款
以下是一个将抚养费和医疗费分开约定的示例条款：
第三条 子女抚养安排
1. 抚养费：
- 甲方每月10日前向乙方支付子女抚养费人民币5000元，直至子女年满18周岁或独立生活为止。
- 如遇物价指数上涨超过10%，双方应协商调整抚养费标准。
- 抚养费仅用于子女日常生活开支，不得挪作他用。
2. 医疗费用：
- 日常门诊、药品费用由直接抚养方（乙方）先行垫付，凭票据每半年结算一次，甲方在收到票据后7日内转账支付。
- 单次治疗费用超过1万元的部分，双方按6:4比例分担（甲方60%，乙方40%）。
- 鼓励为子女购买商业医疗保险，保费由双方均摊。
四、注意事项
- 明确“必要”标准：在协议中界定何为“合理医疗需求”，以避免后续争议。
- 保留证据义务：要求双方保存所有费用票据，便于审计和纠纷解决。
- 违约责任：可以约定逾期支付抚养费或医疗费的违约责任，如收取滞纳金等。
- 动态调整机制：可以约定每两年或根据实际情况协商修订费用标准，以适应经济变化。
五、法律风险提示
- 协议效力：确保协议内容合法合规，并经过民政局备案或法院确认，以增强其法律效力。
- 强制执行：若一方拒付抚养费或医疗费，另一方可申请法院强制执行，但教育/医疗费需先通过诉讼确认责任。
- 未成年子女意见：在涉及重大教育决策（如留学）时，应考虑子女意愿并提交法院参考。
综上所述，将抚养费和医疗费分开写在协议中是可行的，也是推荐的做法。这样的安排有助于明确双方的责任划分，保障子女的权益，减少后续纠纷。在签署协议前，建议咨询专业律师以确保条款的合法性和有效性。