司法亲子鉴定报告若未填写父亲身份证号码，需根据具体用途采取不同处理方式，以下是详细说明：

1. 若鉴定报告用于诉讼
   根据《民事诉讼法》及司法鉴定程序规范，司法亲子鉴定报告需具备法定形式要件，包括被鉴定人身份信息（姓名、身份证号、与当事人关系等）。若未填写父亲身份证号码，可能面临法院不予采信的风险。
   处理建议：立即联系原鉴定机构，要求补充父亲身份证号码并出具《补充说明函》，加盖鉴定机构公章。若机构拒绝补充，可向当地司法局投诉或申请重新鉴定。

2. 若鉴定报告用于非诉讼用途（如落户、公证）
   需根据具体部门要求处理。例如：

   • 落户：根据《户口登记条例》，部分地区要求亲子鉴定报告必须包含父母双方身份证号码，否则公安机关可能拒绝受理。
     
   • 公证：公证处可能要求补充身份信息或出具情况说明，否则可能影响公证效力。
     处理建议：提前咨询目标部门（如派出所、公证处）的具体要求，若需补充信息，按上述诉讼场景处理；若允许出具说明函，可要求鉴定机构配合。

3. 若父亲拒绝配合补充信息
   若父亲故意不提供身份证号码导致无法补充，可能影响鉴定报告的合法性。此时需区分情况：

   • 若父亲是鉴定申请人之一：可依据《司法鉴定程序通则》要求鉴定机构终止鉴定并退还费用，或通过法院委托鉴定（法院可强制要求父亲配合）。
     
   • 若父亲非申请人：需通过协商或法律途径（如起诉确认亲子关系）解决，但过程可能复杂。
     处理建议：优先协商，协商不成可咨询律师制定具体方案。

温馨提示：司法亲子鉴定报告的严谨性直接影响其法律效力，建议务必选择具有司法资质的正规机构，并在鉴定前确认报告需包含的所有信息项。若已遇到问题，可随时向我提供更多细节（如鉴定用途、父亲态度等），我会进一步为您分析解决方案。