医疗纠纷起诉状交给法院后三个月才立案，这通常是不正常的。下面我将从多个角度为您详细分析这个问题：
一般立案时间：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，人民法院在收到起诉状或口头起诉后，对符合起诉条件的，应当在七日内立案，并通知当事人。这是法律对立案时间的一般性规定，旨在保障当事人的诉讼权利，确保诉讼程序的及时进行。
特殊情况下的立案时间：
- 虽然法律有一般性规定，但也存在一些特殊情况可能导致立案时间延长。例如，如果起诉材料存在瑕疵或需要补充相关证据，法院会要求原告在规定期限内进行补正，补正期间立案时间会相应延长。然而，即使在这种情况下，立案时间通常也不会超过14天，远不及您提到的三个月。
- 另外，如果案件涉及重大公共利益、需要协调等特殊情况，立案时间可能会有所波动。但即便如此，三个月的时间也显得过长，不符合常规的立案流程。
可能的原因及建议：
- 法院工作繁忙：如果法院近期案件量较大，工作人员可能无法及时处理所有起诉状，导致立案时间延长。但即便如此，法院也应按照法律规定，在合理时间内完成立案工作。
- 起诉材料问题：如果您的起诉材料存在严重瑕疵或不符合法定形式，法院可能无法直接立案。但法院应会及时通知您补正材料，而不是拖延三个月。
- 建议行动：鉴于您已经等待了三个月，我建议您主动联系法院，了解立案进展情况。如果法院无法给出合理解释或继续拖延立案，您可以考虑向上级法院反映情况或寻求其他法律途径维护自己的权益。
法律后果与注意事项：
- 诉讼时效：在等待立案过程中，您需要注意诉讼时效问题。根据法律规定，您应在知道或应当知道权益受到损害之日起的一定期限内（通常为三年）提起诉讼。如果因法院拖延立案而导致超过诉讼时效，您可能会丧失胜诉权利。
- 医疗事故鉴定：在起诉前，您通常需要先进行医疗事故鉴定，以明确医疗行为与患者损害之间的因果关系。这是后续诉讼的重要证据支持，务必确保鉴定程序的合法性和有效性。
综上所述，医疗纠纷起诉状交给法院后三个月才立案通常是不正常的。我建议您主动联系法院了解情况，并注意诉讼时效和医疗事故鉴定等问题。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。