结论前置：企业法人不是股东的情况下，公司破产的处理主要依据是否达到破产条件，并按法定程序进行。股东是否在企业并不影响破产申请的进行，有权申请企业破产的主体包括债务人（企业自身）、债权人以及依法负有清算责任的人。
一、破产条件与申请主体
根据《中华人民共和国企业破产法》的相关规定，企业法人若不能清偿到期债务，且资产不足以清偿全部债务或明显缺乏清偿能力，或存在明显丧失清偿能力的可能，可依照该法进行重整或清理债务。具体申请主体如下：
债务人（企业自身）：当企业满足破产条件时，企业自身可作为申请人向人民法院提出重整、和解或破产清算申请。即使企业法人不持有公司股份，只要其代表企业，就有权提出申请。
债权人：在债务人不能清偿到期债务的情况下，债权人有权向人民法院提出对债务人进行重整或破产清算的申请。债权人无需关心企业法人的股东身份，只需关注债务人是否满足破产条件。
依法负有清算责任的人：若企业法人已解散但未清算或未清算完毕，且资产不足以清偿债务，依法负有清算责任的人（如特定情况下的股东，但此处股东身份并非申请破产的必要条件，而是指负责清算的人）应向人民法院申请破产清算。
二、申请流程与材料准备
无论由哪个主体申请破产，都需要遵循一定的流程和准备相应的材料：
准备申请材料：
提交申请：将准备好的材料提交至企业所在地的人民法院。
法院审查与受理：人民法院会对提交的申请进行审查，判断是否符合破产法的相关规定。若符合，法院会受理破产申请，并作出相应裁定。
公告与后续程序：法院受理破产后，会进行公告，并指定管理人接管企业财产，开展清算工作。债务人需配合管理人移交财产、印章等资料，并如实回答询问。
三、特殊情况与注意事项
股东角色：在企业破产过程中，股东通常不能直接申请破产，除非其是企业法定代表人或债权人。若股东是企业法定代表人，则可代表企业以债务人身份申请；若股东是企业债权人，也能以债权人身份申请。但股东身份本身并不构成申请破产的直接依据。
费用缴纳：申请破产需向法院缴交受理费，费用依据破产财产总额计算，按财产案件受理费标准减半交纳，但最高不超过30万元。
管理人的指定：根据《企业破产法》第十三条，人民法院裁定受理破产申请的，应同时指定管理人，由相关部门、机构或社会中介机构担任。管理人将负责接管企业财产、开展清算工作等。
四、法律后果与影响
企业破产将对企业、股东、债权人等各方产生深远影响。对于企业而言，破产可能导致企业解散、资产被清算、业务终止等；对于股东而言，破产可能导致其投资损失、股权价值归零等；对于债权人而言，破产可能导致其债权无法全额受偿、需要参与破产程序等。因此，在申请破产前，各方应充分评估法律后果与影响，并谨慎决策。
综上所述，企业法人不是股东的情况下，公司破产的处理主要依据是否达到破产条件，并按法定程序进行。在申请破产过程中，需确保材料齐全、准确，并遵循法院的指导和要求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。