结论前置：公司市内跨区搬迁时，员工是否有权获得补偿，主要取决于搬迁是否对劳动合同的履行造成了实质性影响，以及双方是否能就劳动合同变更达成一致。若搬迁导致合同无法履行且协商未果，公司需支付经济补偿；反之，则可能无需赔偿。
详细分析：
劳动合同无法继续履行的情况：
- 如果公司跨区搬迁的距离较远，给员工上下班带来极大不便，如从城市的一个区搬到另一个偏远的区，导致员工难以按照原劳动合同约定的工作地点继续工作，且双方未能就变更工作地点或其他相关劳动合同内容达成一致，那么公司解除劳动合同时，需要向员工支付经济补偿。
- 经济补偿的计算方式：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
劳动合同可以继续履行的情况：
- 如果公司跨区搬迁距离较近，对员工的工作和生活影响较小，如在同一个城市的相邻区域搬迁，且公司采取了合理措施减少对员工的影响（如提供班车接送、交通补贴等），员工能够继续按照劳动合同约定的条件工作，那么劳动合同可以继续履行，公司无需支付经济补偿。
- 另外，如果公司与员工就搬迁事宜协商一致，对劳动合同的工作地点等内容进行了变更，员工也同意在新地点工作，这种情况下同样不存在因搬迁而产生的赔偿问题。
特殊情况的考虑：
- 孕期、产期、哺乳期女职工：对于处于孕期、产期、哺乳期的女职工，公司应特别关注其权益保护，不得因搬迁而降低其工资待遇或解除劳动合同。如需变更工作地点，应与女职工协商一致，并尽可能提供便利条件。
- 工伤职工：工伤职工在停工留薪期内，公司不得因搬迁而降低其原工资福利待遇。停工留薪期满后，应根据伤残等级和劳动能力鉴定结果，按照国家有关规定享受相应的工伤保险待遇。
员工维权途径：
如果公司跨区搬迁后未按照法律规定给予员工相应的补偿，员工可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
- 首先与公司管理层进行理性沟通，表达自己的诉求和立场，寻求双方都能接受的解决方案。
- 若沟通无果，可以寻求法律援助或直接向我咨询，了解具体的法律救济途径。
- 收集并整理好所有与搬迁和劳动合同相关的证据材料，如劳动合同文本、搬迁通知、工资单等。
- 向当地人力资源和社会保障局内的劳动争议仲裁委申请劳动仲裁，或者直接向人民法院提起诉讼以维护自身权益。
综上所述，公司市内跨区搬迁时员工是否有赔偿取决于多种因素，包括搬迁对员工工作和生活的影响程度以及双方协商的结果。在面临此类情况时，员工应了解自己的权利和法律途径，以便在必要时采取适当的行动来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。