废品站在不知情的情况下收购涉案车辆，一般不构成犯罪，但需承担相应的民事或行政责任，具体处理方式需根据实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 刑事责任角度
   根据《中华人民共和国刑法》第三百一十二条，掩饰、隐瞒犯罪所得罪要求行为人“明知”是犯罪所得而予以窝藏、转移、收购、代为销售。若废品站能证明自身确实不知情（如车辆外观无明显异常、交易价格合理、无逃避监管行为等），则不构成该罪。但需注意：司法实践中可能通过交易时间、地点、价格等客观因素推定“明知”，因此需保留相关证据（如进货记录、交易凭证）证明主观无过错。

2. 民事责任角度
   若车辆为被盗抢等涉案财物，原车主有权依据《中华人民共和国民法典》第三百一十四条要求废品站返还车辆。若车辆已被拆解或无法返还，废品站需承担赔偿责任，赔偿范围以车辆实际价值为限。但若废品站能证明自身无过错（如已尽合理审查义务），可主张减轻或免除责任。

3. 行政责任角度
   根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第五十九条，收购赃物、有赃物嫌疑的物品的，可处五百元以上一千元以下罚款；情节严重的，处五日以上十日以下拘留，并处五百元以上一千元以下罚款。即使废品站不知情，若未履行基本审查义务（如核对车辆证件、询问来源），仍可能面临行政处罚。

建议处理步骤：

1. 立即停止处置车辆：避免因拆解、转卖等行为扩大损失或引发新的法律风险。
   
2. 主动向公安机关报备：说明收购经过，配合调查，证明自身无主观过错。
   
3. 保留交易证据：如进货发票、交易记录、车辆照片等，以备后续维权或抗辩使用。
   
4. 协商或诉讼解决：若原车主主张返还或赔偿，可协商解决；协商不成，可通过诉讼明确责任分担。
   

如有进一步疑问或需具体指导，可直接向我咨询，我会结合案件细节提供更精准的建议。