自建房基础工程地基基础质保50年，这一做法的合法性需结合具体情况分析，不能一概而论。以下从不同角度进行详细阐述：
一、质保期限的法律依据
《建设工程质量管理条例》的相关规定：
- 根据《建设工程质量管理条例》第四十条，在正常使用条件下，建设工程的最低保修期限为：
- 基础设施工程、房屋建筑的地基基础工程和主体结构工程，为设计文件规定的该工程的合理使用年限；
- 屋面防水工程、有防水要求的卫生间、房间和外墙面的防渗漏，为5年；
- 供热与供冷系统，为2个采暖期、供冷期；
- 电气管线、给排水管道、设备安装和装修工程，为2年。
- 关键点：地基基础工程的质保期限应与设计文件规定的合理使用年限一致，而非固定年限。若设计文件规定的合理使用年限为50年，则质保50年是合法的；若设计文件规定的合理使用年限短于50年，则质保50年可能缺乏法律依据。
合同约定优先原则：
- 在建设工程合同中，双方可以约定质保期限。若合同中明确约定地基基础工程的质保期限为50年，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，则该约定是有效的。
- 关键点：合同约定需明确、具体，且不得违反法律、行政法规的强制性规定。若合同约定与法律规定不一致，应以法律规定为准，但法律另有规定的除外。
二、质保50年的合理性分析
技术可行性：
- 地基基础工程是建筑物稳定性和安全性的关键。随着建筑技术的不断进步，一些新型地基基础材料和技术能够显著提高地基的承载力和耐久性，使得地基基础工程的使用寿命延长至50年甚至更长成为可能。
- 关键点：质保50年需基于可靠的技术和材料支持，确保地基基础工程在设计使用年限内能够保持稳定性和安全性。
经济合理性：
- 质保50年意味着施工单位需承担更长时间的保修责任，这可能导致施工成本的增加。然而，从长远来看，高质量的地基基础工程能够减少建筑物的维修和改造费用，提高建筑物的使用寿命和价值。
- 关键点：业主和施工单位需在合同中明确质保期限和保修责任，以及因质保期限延长而可能产生的费用分担方式，确保经济合理性。
三、法律建议
审查设计文件：
- 在签订建设工程合同前，业主应仔细审查设计文件，了解地基基础工程的合理使用年限。若设计文件规定的合理使用年限为50年，则质保50年是合法的；若短于50年，则需与施工单位协商并明确约定质保期限。
明确合同约定：
- 在合同中明确约定地基基础工程的质保期限、保修责任以及费用分担方式。确保合同约定明确、具体，且不违反法律、行政法规的强制性规定。
咨询专业律师：
- 若对质保期限的合法性或合同约定存在疑问，建议咨询专业律师。律师能够根据具体情况提供法律意见和建议，帮助业主和施工单位明确权利义务关系，避免法律纠纷。
总结：自建房基础工程地基基础质保50年是否合法，需结合设计文件规定的合理使用年限和合同约定进行判断。若设计文件规定的合理使用年限为50年或合同中明确约定质保期限为50年，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，则质保50年是合法的。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。