当发现他人占用自家土地作为墓地时，这确实是一个既涉及法律权益又关乎人情世故的复杂问题。为了妥善处理这一问题，我建议您按照以下步骤进行：

一、保持冷静与理性

首先，务必保持冷静和理性，避免因为情绪激动而采取过激行为。冲动行事可能会加剧矛盾，不利于问题的和平解决。

二、确认土地权属并收集证据

1. 核查权属证明：仔细核查您的土地使用证或土地承包合同，确保土地的使用权归属清晰无误。这是后续处理问题的法律基础。
2. 现场勘查与取证：亲自前往被占用的土地进行勘查，明确被占用的具体范围、面积以及现状。同时，使用相机或手机拍摄现场照片和视频，作为后续维权的证据。
3. 获取其他书面材料：如果可能，收集与土地相关的其他书面材料，如土地规划图、历史使用记录等，以进一步证明您对这块土地的合法权益。

三、尝试沟通协商

1. 寻找坟主及其家属：通过村委会、居委会或其他可靠渠道联系坟主及其家属，以平和的态度说明情况，表达您的诉求。
2. 提出解决方案：双方可以探讨多种解决方案，如迁移坟墓至公共墓地、支付土地使用费或赔偿金等。在提出方案时，要充分考虑对方的实际情况和合理诉求，力求达成共识。

四、寻求第三方调解

1. 基层组织调解：若自行协商无果，可以请求村委会、居委会等基层组织介入调解。这些机构通常具有威望和熟悉当地情况的优势，能够协助双方找到合理的解决方案。
2. 政府相关部门调解：如果基层组织调解无果，还可以向土地管理部门、民政部门等政府机构求助。这些部门具有专业的法律知识和调解经验，能够依据相关法律法规和政策进行专业调解。

五、法律途径维权

1. 提起民事诉讼：若调解仍无法解决问题，您可以以土地侵权为由向人民法院提起民事诉讼。在诉讼过程中，需要提供充分的证据证明自己对土地的合法权益以及对方侵占土地的事实。法院将依法判决对方停止侵权行为并赔偿损失。
2. 行政投诉：如果发现坟墓建设违反行政法规（如在禁止区域内建造），您还可以向相关行政部门投诉，要求其依法查处违规行为。

六、注意事项

1. 遵守法律法规：在处理此类纠纷时，必须严格遵守国家法律法规，不得采取过激行为或违法手段。
2. 尊重风俗习惯：考虑到坟墓涉及逝者和家族情感，处理时应尽量尊重当地的风俗习惯，避免引发不必要的冲突和矛盾。
3. 及时行动：一旦发现土地被侵占，应及时采取行动，以免错过最佳维权时机。同时，要保持与相关部门的沟通联系，及时了解处理进展。

综上所述，处理他人占用自家土地作墓地的问题需要谨慎而耐心。通过明确土地权属、收集证据、沟通协商、寻求第三方调解以及必要时采取法律途径，相信您能够找到一个既尊重逝者又维护自身合法权益的合理解决方案。