网贷担保融资公司跨区收取费用是否合法，需分情况讨论：

1. 若公司具备跨区经营资质且费用收取符合合同约定与法律规定：

   • 合法性分析：网贷担保融资公司若依法取得了跨区经营的相关资质或许可，且其与客户签订的合同中明确约定了跨区收取费用的条款，同时该费用收取标准未违反国家法律法规的强制性规定（如利率上限、服务费标准等），则其跨区收取费用的行为是合法的。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于合同自由与公平原则的规定，合同双方有权在平等自愿的基础上约定合同内容，包括费用收取等条款。只要该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，即具有法律效力。

2. 若公司不具备跨区经营资质或费用收取违反合同约定与法律规定：

   • 违法性分析：若网贷担保融资公司未依法取得跨区经营的相关资质或许可，或者其与客户签订的合同中未明确约定跨区收取费用，或者费用收取标准违反了国家法律法规的强制性规定（如超出了法定利率上限、服务费标准过高等），则其跨区收取费用的行为是违法的。
   • 法律后果：根据相关法律法规，违法收取费用的公司可能面临行政处罚（如罚款、吊销营业执照等），同时，客户也有权要求公司退还违法收取的费用，并可能要求公司承担违约责任或赔偿责任。

额外建议与风险提示：

• 核实公司资质：在签订合同前，客户应核实网贷担保融资公司是否具备跨区经营的相关资质或许可，以及是否在相关监管部门进行了备案登记。
• 仔细阅读合同条款：客户在签订合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于费用收取的条款，确保自己完全理解并同意合同内容。
• 保留相关证据：客户在交易过程中应保留好相关证据（如合同、转账记录、沟通记录等），以便在发生纠纷时能够证明自己的权益。
• 及时咨询专业律师：若客户对网贷担保融资公司的跨区收取费用行为存在疑问或担忧，建议及时咨询专业律师，以便获得更具体的法律建议和帮助。

总结：网贷担保融资公司跨区收取费用是否合法，取决于公司是否具备跨区经营资质、费用收取是否符合合同约定与法律规定。客户在签订合同前应核实公司资质、仔细阅读合同条款，并在交易过程中保留好相关证据。如有任何疑问或担忧，建议及时向我咨询。