关于违法分包追溯期及违法行为终止时间的计算问题，核心结论如下：

1. 违法分包行为的追溯期（行政处罚时效）
   根据《行政处罚法》第三十六条，违法分包的行政处罚追溯期为2年，自违法行为终了之日起计算。但若违法行为涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果，追溯期可延长至5年。

   • 关键点：若违法分包行为持续存在（如长期未结算工程款、持续履行违法分包合同），则追溯期从行为终止之日（如合同解除、工程竣工验收合格且分包关系实际终结）起算。
     
   • 例外：若违法分包行为被行政机关立案调查但未作出处罚，或行为人逃避处罚，追溯期不受2年限制，但需以行政机关发现违法行为为前提。

2. 违法分包行为终止时间的认定
   违法分包行为的终止时间需结合具体情形判断，常见标准包括：

   • 合同履行完毕：分包工程通过竣工验收且分包合同权利义务实际履行完毕（如工程款结清、缺陷责任期届满）。
     
   • 合同解除或无效确认：若分包合同被依法解除或认定为无效，终止时间为合同解除/无效判决生效之日。
     
   • 实际停止分包行为：若分包人未完成合同即撤场，终止时间为实际撤场且发包人接管工程之日。
     
   • 行政干预时间：若行政机关责令改正违法分包行为，终止时间为改正完成之日（如重新签订合法分包合同或发包人自行完成剩余工程）。

实务建议：

• 若涉及行政处罚，需重点核查违法分包行为的持续性及终止时间证据（如竣工验收报告、合同解除协议、行政机关整改通知等）。
  
• 若追溯期已过，行政机关原则上不得处罚，但需注意“持续状态”的认定（如分包人长期参与工程管理可能被认定为行为未终止）。
  
• 民事纠纷中（如追讨工程款），违法分包不影响合同相对性原则，但可能影响付款责任主体（如总承包人可能需承担连带责任）。
  

如有具体案件细节（如分包合同期限、行政处罚时间、工程现状等），可进一步向我咨询，我会结合证据链分析终止时间及法律风险。