在合同中约定“先开发票再付款”的条款时，需明确双方权利义务、发票开具与付款的时间节点、违约责任等内容，以保障合同顺利履行并降低法律风险。以下为具体条款设计思路及示例：

一、条款设计核心要点

1. 明确发票开具与付款的先后顺序
   需在合同中清晰约定“乙方应在收到甲方付款通知后X个工作日内开具合法有效的增值税专用发票，甲方在收到发票后X个工作日内完成付款”。避免使用模糊表述（如“尽快”“随后”），防止因理解分歧引发纠纷。

2. 约定发票类型及信息准确性
   明确发票类型（如增值税专用发票/普通发票）、税率、抬头、纳税人识别号等信息，并要求乙方对发票真实性、合法性负责。若因发票问题导致甲方无法抵扣税款或遭受损失，乙方应承担赔偿责任。

3. 设置付款前提条件
   可约定“甲方付款前，乙方需提供发票及与发票金额一致的收款账户信息，并确认无未了结的债权债务纠纷”。若乙方未履行前述义务，甲方有权暂停付款且不承担违约责任。

4. 细化违约责任

   • 若乙方未按期开具发票，每逾期一日按未开票金额的X%支付违约金；逾期超过X日的，甲方有权解除合同并要求赔偿损失。
     
   • 若甲方收到发票后无正当理由拒付，每逾期一日按应付未付金额的X%支付违约金，并承担乙方追索款项的合理费用（如律师费、诉讼费等）。

二、合同条款示例

第六条 发票开具与付款
6.1 乙方应在每次完成服务/交付货物后，根据甲方要求开具合法有效的增值税专用发票（税率X%），发票内容应与合同约定一致。
6.2 甲方应在收到乙方开具的发票后X个工作日内完成审核，确认无误后于X个工作日内将款项支付至乙方指定账户。
6.3 若乙方开具的发票不符合税法规定或合同约定，甲方有权要求乙方重新开具或补开，直至符合要求为止。在此期间，甲方付款时间相应顺延，且不承担逾期付款责任。
6.4 任何一方违反本条约定，应向对方支付合同总金额X%的违约金，并赔偿因此造成的全部损失。

三、风险提示与建议

1. 关注发票合规性
   乙方开具的发票需符合《增值税暂行条例》及《发票管理办法》规定，否则可能面临税务处罚，且甲方有权拒绝付款直至发票合法有效。

2. 保留履约证据
   双方应妥善保存发票交付、付款通知、沟通记录等证据，以备争议时举证。建议通过书面形式（如邮件、签字确认单）确认发票接收及付款安排。

3. 动态调整条款
   若合同履行期间税法政策变更（如税率调整），双方应及时协商修改合同条款，避免因政策变化导致合同无法履行或利益失衡。

若您需要进一步优化合同条款或针对具体场景设计协议，可直接向我咨询，我将结合实务经验为您提供专业建议。