企业签订劳动合同两年和三年的主要区别体现在合同期限、试用期设定、经济补偿计算以及合同续签与终止的处理上。下面我将从这几个方面详细阐述：

1. 合同期限：

   • 两年期合同：合同期限为两年，到期后双方如无异议，可以续签或自然终止。
   • 三年期合同：合同期限为三年，相比两年期合同，提供了更长的雇佣关系稳定期。

2. 试用期设定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，劳动合同期限三个月以上不满一年的，试用期不得超过一个月；劳动合同期限一年以上不满三年的，试用期不得超过二个月；三年以上固定期限和无固定期限的劳动合同，试用期不得超过六个月。
   • 因此，两年期合同的试用期最长可设定为二个月，而三年期合同的试用期最长可设定为六个月。这意味着，三年期合同在试用期方面提供了更长的考察期，有助于企业更全面地了解员工的工作能力和适应情况。

3. 经济补偿计算：

   • 当劳动合同因各种原因需要解除或终止时，企业可能需要向员工支付经济补偿。经济补偿的计算通常与员工的工作年限和月工资有关。
   • 在两年期合同和三年期合同下，如果员工在企业工作满相应年限后合同终止或解除，且符合支付经济补偿的条件，那么三年期合同下的员工将因工作年限更长而可能获得更高的经济补偿。

4. 合同续签与终止：

   • 两年期合同到期后，如果双方希望继续合作，需要重新签订劳动合同或续签原合同。
   • 三年期合同则提供了更长的合作期限，减少了合同续签的频率和成本。同时，如果合同在三年内因特定原因需要提前终止，双方需要按照合同约定或法律规定处理相关事宜。

额外建议：

• 企业在选择签订两年期还是三年期合同时，应综合考虑自身的业务需求、员工管理策略以及法律法规的要求。
• 对于需要长期稳定雇佣关系的岗位，三年期合同可能更为合适；而对于需要灵活调整雇佣关系的岗位，两年期合同可能更为灵活。
• 无论选择哪种期限的合同，企业都应确保合同内容合法合规，明确双方的权利和义务，以避免潜在的劳动纠纷。

如果您在劳动合同签订或管理过程中遇到任何法律问题，如合同条款的设定、试用期的处理、经济补偿的计算等，都可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。