商务局确实有查处商务合同中格式合同霸王条款的职责，但这一职责通常是在其作为市场监管部门的一部分职责范围内行使的，且具体职责可能因地区和具体法律法规而有所差异。以下是对这一问题的详细分析：

一、商务局的职责范围

商务局作为政府的一个部门，其职责通常包括促进市场公平竞争、维护市场秩序、保护消费者权益等。在商务合同领域，商务局有权对合同中的不公平条款进行监管，特别是针对格式合同中的霸王条款。这些霸王条款往往损害消费者的合法权益，破坏市场公平竞争环境，因此商务局有责任进行查处。

二、格式合同霸王条款的定义与危害

格式合同霸王条款是指合同中一方当事人预先拟定的、未与对方协商的、对对方不利的条款。这些条款往往违反公平、等价有偿的原则，损害消费者的合法权益。例如，一些商家在格式合同中设置“最终解释权归商家所有”等条款，限制了消费者的权利，增加了消费者的义务，属于典型的霸王条款。

三、商务局查处格式合同霸王条款的法律依据

1. 《中华人民共和国消费者权益保护法》：该法明确规定了消费者享有公平交易的权利，经营者不得以格式条款等方式作出对消费者不公平、不合理的规定。商务局作为市场监管部门，有权依据该法对格式合同中的霸王条款进行查处。
2. 《中华人民共和国民法典》：民法典中关于合同的规定也强调了合同的公平性和自愿性。对于格式合同中的霸王条款，如果违反了民法典的相关规定，商务局同样有权进行查处。
3. 地方性法规和规章：各地可能根据实际情况制定了关于格式合同监管的地方性法规和规章，商务局在执行这些法规和规章时，也有权对格式合同中的霸王条款进行查处。

四、商务局查处格式合同霸王条款的具体方式

1. 监督检查：商务局可以通过定期或不定期的监督检查，对市场上的格式合同进行审查，发现霸王条款及时进行处理。
2. 投诉处理：商务局可以设立投诉渠道，接受消费者对格式合同中霸王条款的投诉，并进行调查处理。
3. 行政处罚：对于违反相关法律法规的格式合同霸王条款，商务局可以依法对经营者进行行政处罚，如罚款、责令改正等。

五、建议与提醒

1. 消费者应增强自我保护意识：在签订格式合同时，消费者应仔细阅读合同条款，特别是那些可能对自己不利的条款。如果发现霸王条款，应及时向商务局或相关消费者权益保护机构投诉。
2. 经营者应遵守法律法规：经营者在制定格式合同时，应遵守相关法律法规的规定，确保合同条款的公平性和合理性。避免设置霸王条款，以免引发法律纠纷和行政处罚。

如果您在商务合同中遇到了霸王条款的问题，或者对商务局的职责有进一步的疑问，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。