这种行为一般是不合法的，以下从不同角度为你详细分析：
从公司财务管理制度角度
公司备用金通常有严格的管理规定，一般应通过正规财务流程用于公司业务相关支出，且应转账至对公账户或符合规定的供应商账户等。未经员工本人同意，将备用金转至个人账号备注借款，这明显违反了公司正常的财务审批和资金流转程序。公司有义务保障资金的安全和合理使用，这种随意转账行为可能破坏公司财务秩序，导致资金管理混乱，甚至可能引发内部腐败等问题。
从员工权益保护角度
员工个人账号属于其私人财产范畴，公司未经员工同意擅自将资金转入，侵犯了员工对自己账户资金的控制权和财产权益。即使备注为借款，但未经员工认可，这种“借款”关系在法律上也是存在瑕疵的。员工有权拒绝这种未经同意的资金转入，并要求公司纠正错误行为，若因此给员工造成损失，如账户被冻结、产生不必要的税务问题等，员工有权要求公司进行赔偿。
从税务和法律风险角度
这种操作可能带来税务和法律方面的风险。对于公司而言，未经合理流程将备用金转至个人账户，可能被税务机关认定为违规操作，面临税务处罚，如补缴税款、加收滞纳金和罚款等。从法律层面，如果这种行为被认定为恶意转移资金、逃避债务等，公司及相关责任人可能需要承担相应的法律责任。对于个人而言，不明不白地收到公司转入的资金并备注借款，可能会在个人税务申报、信用记录等方面产生不良影响。
如果遇到这种情况，建议你先与公司沟通，要求公司说明转账原因并纠正错误行为，保留好相关沟通记录。若公司不予理会或处理不当，你可以进一步向劳动监察部门投诉或通过法律途径维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的帮助，随时都可以问我。