当有限责任公司股东之间的合约与公司章程相矛盾时，一般应以公司章程为准，但具体还需根据矛盾内容、签订时间及是否经过法定程序修改等因素综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律原则与规定
公司章程的法定性：
- 公司章程是公司设立时必须制定的基本法律文件，它规定了公司的组织结构、运营方式、股东权利与义务等核心内容，具有法定性和公开性。
- 根据《公司法》的相关规定，公司章程对公司、股东、董事、监事、高级管理人员具有约束力。这意味着，公司章程的内容是公司运营和股东行为的基本准则。
股东合约的相对性：
- 股东之间的合约，如股东协议、合作协议等，是股东之间就特定事项达成的约定。这些合约通常只对签约股东具有约束力，而不涉及公司其他股东或公司本身。
- 股东合约的内容如果与公司章程相冲突，且未经过法定程序修改公司章程，则该合约内容可能无法对抗公司章程的效力。
二、矛盾处理的具体情况
矛盾内容涉及公司基本制度：
- 如果股东之间的合约与公司章程在涉及公司基本制度（如公司治理结构、股东权利与义务、利润分配等）方面存在矛盾，且该矛盾无法通过协商解决，则一般应以公司章程为准。
- 这是因为公司章程是公司设立和运营的基础，其内容具有更高的法律效力和稳定性。
股东合约签订时间晚于公司章程：
- 如果股东之间的合约是在公司章程制定之后签订的，且该合约内容明确修改了公司章程中的某些条款，但未经法定程序（如股东会决议）修改公司章程，则该合约的效力可能受到质疑。
- 在这种情况下，股东应尽快通过法定程序修改公司章程，以使合约内容与公司章程保持一致。
股东合约经过法定程序修改公司章程：
- 如果股东之间的合约内容已经通过法定程序（如股东会决议）修改了公司章程，则该合约内容与公司章程具有同等法律效力。
- 在这种情况下，如果再次出现矛盾，应依据修改后的公司章程（即包含合约内容的公司章程）来处理。
三、法律建议与后果
法律建议：
- 股东在签订合约时，应仔细审查公司章程的内容，确保合约内容与公司章程不冲突。
- 如果合约内容需要修改公司章程，应通过法定程序进行修改，并确保修改后的公司章程得到所有股东的认可和遵守。
- 在出现矛盾时，股东应首先尝试通过协商解决；协商不成的，可以寻求法律途径解决，如提起诉讼或仲裁。
可能的法律后果：
- 如果股东之间的合约与公司章程相矛盾，且未经过法定程序修改公司章程，则该合约内容可能无法得到法律的保护和执行。
- 在这种情况下，股东可能面临违约责任、损害赔偿责任等法律风险。
举例说明：假设公司章程中规定利润分配比例为股东A占60%、股东B占40%，但股东A和股东B后来签订了一份合约，约定利润分配比例为各占50%。如果这份合约未经法定程序修改公司章程，那么在公司实际分配利润时，仍应按照公司章程的规定进行分配。如果股东A和股东B因此产生纠纷并诉诸法律，法院很可能会依据公司章程的规定来判决利润分配比例。
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