针对您提出的“电动自行车抵扣不过户会怎么样处罚”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，电动自行车在转卖或抵扣后，如果未办理过户手续，原车主在法律上仍然被视为该车辆的所有人。这意味着，如果旧车在后续行驶中产生任何违规行为，如交通事故、交通违法等，原车主都有可能需要承担相应的法律责任。

具体来说，如果旧车在未过户的情况下发生交通事故，且事故责任被判定为旧车一方，那么原车主作为法律上的车辆所有人，可能需要承担赔偿责任。此外，如果旧车存在交通违法行为，如闯红灯、逆行等，且这些违法行为被交通管理部门查处，那么原车主也可能需要接受相应的处罚，包括但不限于罚款、扣分等。

为了避免这些不必要的法律风险和麻烦，我建议您在电动自行车抵扣或转卖后，务必及时办理过户手续。过户手续通常需要新车主和原车主双方携带身份证、车辆行驶证等相关证件，到指定的交通管理部门或邮政窗口进行办理。办理过户手续后，新车主将成为车辆的合法所有人，原车主则不再承担与该车辆相关的任何法律责任。

另外，您提到的商家说“直接把行驶证给商家就行，行驶证是跟着车走的”，这种说法是不准确的。行驶证是车辆的重要证件之一，但它并不“跟着车走”。在车辆转卖或抵扣后，行驶证需要随着车辆一起过户给新车主，或者由原车主进行注销处理。如果仅将行驶证交给商家而不办理过户或注销手续，那么原车主仍然可能面临上述的法律风险。

综上所述，为了保障自己的合法权益和避免不必要的法律风险，我强烈建议您在电动自行车抵扣或转卖后及时办理过户手续。如果您对过户手续的具体流程或所需材料有任何疑问，可以咨询当地的交通管理部门或邮政窗口工作人员。