造船厂违规占用岸线，需根据具体违规情形，通过行政处罚、民事赔偿、刑事追责等途径处理，同时可结合生态修复等措施恢复岸线原状。具体分析如下：

1. 行政处罚

   • 处罚依据：根据《中华人民共和国港口法》《中华人民共和国水法》《中华人民共和国防洪法》等相关法律法规，造船厂违规占用岸线可能面临行政处罚。例如，《港口法》第四十五条规定，未经依法批准在港口建设危险货物作业场所、实施卫生除害处理的专用场所的，或者建设的危险货物作业场所、实施卫生除害处理的专用场所与人口密集区或者港口客运设施的距离不符合国务院有关部门的规定的，由港口行政管理部门责令停止建设或者使用，限期改正，可以处五万元以下罚款。
   • 处罚措施：行政处罚措施可能包括责令停止违法行为、限期拆除违规建筑、恢复原状、罚款等。具体处罚措施需根据违规行为的性质、情节和后果等因素综合确定。

2. 民事赔偿

   • 赔偿依据：如果造船厂的违规占用岸线行为给其他民事主体（如相邻土地所有者、使用者或港口经营者等）造成了损失，受损方有权要求造船厂承担民事赔偿责任。
   • 赔偿范围：民事赔偿范围通常包括直接经济损失（如因岸线被占用而无法使用的损失、因违规行为导致的财产损失等）和间接经济损失（如因岸线被占用而错过的商业机会等）。具体赔偿范围需根据受损方的实际损失和造船厂的过错程度等因素综合确定。

3. 刑事追责

   • 追责依据：在极端情况下，如果造船厂的违规占用岸线行为构成犯罪（如非法占用农用地罪、环境污染罪等），则可能面临刑事追责。
   • 追责措施：刑事追责措施包括有期徒刑、拘役、罚金等。具体追责措施需根据犯罪行为的性质、情节和后果等因素综合确定。

4. 生态修复与恢复原状

   • 修复依据：根据相关法律法规，造船厂在违规占用岸线后，除了承担行政处罚、民事赔偿或刑事追责外，还可能需要承担生态修复责任，将岸线恢复至原状或符合相关标准的状态。
   • 修复措施：生态修复措施可能包括拆除违规建筑、清理岸线垃圾、种植植被、恢复湿地等。具体修复措施需根据岸线的实际情况和生态修复要求等因素综合确定。