未经过商家同意，仅退款是否违法，需要结合具体情境来判断。以下是对这一问题的详细分析：
合法情况下的仅退款：
- 如果消费者因商品质量问题、卖家虚假宣传或未按约定提供商品等合法理由申请仅退款，这是消费者的合法权益，通常不构成违法。在这种情况下，即使商家未明确同意，消费者也有权申请仅退款，并且这一行为受到法律保护。
滥用权利情况下的仅退款：
- 然而，如果消费者无正当理由恶意申请仅退款，可能会被视为滥用权利，违反诚实信用原则。在这种情况下，商家有权拒绝退款要求，并可以要求消费者承担相应责任。如果消费者频繁且无正当理由地滥用仅退款政策，甚至可能构成诈骗行为，需要承担法律责任。
平台规则与仅退款：
- 以拼多多平台为例，平台为了保障消费者权益，提供了仅退款服务。在特定情况下，如商品存在质量问题、与描述不符等，且符合平台政策，消费者可以申请仅退款。平台会对仅退款申请进行审核，以确保其合理性。若平台判定仅退款申请合理，并自动执行退款，这通常意味着平台认可了消费者的诉求。
你的具体情况：
- 在你描述的情况下，由于快递停运导致无法退货，你申请了仅退款。商家既未同意也未拒绝，而是选择了起诉。但随后平台直接给你自动退款了。从这一流程来看，平台的自动退款行为可能是基于其内部审核机制认为你的仅退款申请是合理的。因此，在这种情况下，你的仅退款行为并不构成违法。
综上所述，未经过商家同意的仅退款行为是否违法，需要根据具体情况来判断。如果消费者有合法理由申请仅退款，且符合平台政策或法律规定，那么这一行为通常不构成违法。但如果消费者滥用权利或构成诈骗行为，则需要承担相应的法律责任。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。