结论：单位公务派车给患有癫痫的同事，若其开车时发生事故，单位可能需要承担一定的责任，但具体责任划分需根据事故具体情况、同事的病情状况以及单位的管理责任等多方面因素综合判断。以下从不同角度进行详细分析：
一、单位责任分析
选任过失责任：
- 单位在选派驾驶员时，有义务对驾驶员的身体状况、驾驶技能等进行全面审查。若单位明知同事患有癫痫等可能影响驾驶安全的疾病，仍选派其执行公务，则单位可能因选任过失而承担相应的法律责任。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一千一百九十一条：“用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任。用人单位承担侵权责任后，可以向有故意或者重大过失的工作人员追偿。” 若单位在选派驾驶员时存在过失，可能被视为对事故发生有过错，从而承担相应责任。
管理责任：
- 单位对公务车辆和驾驶员有管理责任。若单位未对驾驶员进行必要的健康检查，或未对患有影响驾驶安全疾病的驾驶员采取相应措施（如调整岗位、禁止驾驶等），则单位可能因管理不善而承担责任。
- 实践建议：单位应建立完善的驾驶员健康管理制度，定期对驾驶员进行健康检查，确保驾驶员身体状况符合驾驶要求。
二、同事个人责任分析
过错责任：
- 若同事在明知自己患有癫痫等可能影响驾驶安全的疾病的情况下，仍坚持驾驶公务车辆，并因此导致事故发生，则同事个人可能因过错而承担相应的法律责任。
- 法律依据：根据《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法律法规，驾驶员有义务确保自己身体状况符合驾驶要求。若因驾驶员身体原因导致事故发生，驾驶员可能承担相应的法律责任。
病情突发不可抗力：
- 若同事在驾驶过程中突发癫痫，且该突发情况无法预见、无法避免且无法克服，则同事可能因病情突发属于不可抗力而减轻或免除责任。但这种情况需要具体证据支持，且同事在事故发生前应已尽到合理的注意义务。
三、事故处理建议
立即报警并保护现场：
- 事故发生后，应立即报警并保护现场，以便交警部门进行事故调查和责任认定。
收集证据：
- 收集与事故相关的所有证据，包括现场照片、视频、证人证言、医疗记录等，以便在后续的法律程序中证明自己的权益。
咨询专业律师：
- 在处理此类复杂事故时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。律师可以根据事故具体情况、相关法律法规以及司法实践，为你提供全面的法律分析和处理建议。不过，作为曹勇律师，我可以直接为你提供这方面的法律咨询，你有问题可以直接向我咨询。
协商与诉讼：
- 根据事故责任认定和损失情况，与对方进行协商解决。若协商无果，则可以通过诉讼途径维护自己的合法权益。
总结与进一步思考：单位公务派车给患有癫痫的同事开车发生事故时，单位和同事个人都可能承担一定的责任。具体责任划分需根据事故具体情况、同事的病情状况以及单位的管理责任等多方面因素综合判断。在处理此类事故时，建议立即报警、收集证据、咨询专业律师，并根据事故责任认定和损失情况选择合适的处理方式。