关于自建房墙体分开、楼顶渗水纠纷，根据《民法典》的相关规定，主要涉及相邻关系和建筑物区分所有权的问题，以下分情况为您详细解答：

1. 若自建房虽墙体分开，但楼顶属于共有部分：

   • 法律背景：根据《民法典》第二百七十一条，业主对建筑物内的住宅、经营性用房等专有部分享有所有权，对专有部分以外的共有部分享有共有和共同管理的权利。楼顶作为建筑物的重要组成部分，通常属于共有部分。
   • 法律建议：若楼顶渗水是由于共有部分的维护问题导致，那么所有共有权人（即各房屋的所有者）都有责任共同承担维修费用。在此情况下，您可以与其他共有权人协商，共同出资进行维修。若协商不成，可以通过法律途径解决，如向法院提起诉讼，要求共有权人共同承担维修责任。

2. 若自建房墙体分开，且楼顶明确归属于某一房屋所有者：

   • 法律背景：如果楼顶在规划或建设时就被明确归属于某一房屋的所有者，那么该所有者对楼顶享有专有权利，同时也应承担相应的维护责任。
   • 法律建议：在此情况下，若楼顶渗水是由于该专有部分所有者的维护不当导致，那么该所有者应自行承担维修责任。若渗水问题影响到了其他房屋的所有者，受损方有权要求侵权方进行赔偿或修复。若双方无法达成一致，可以通过法律途径解决纠纷。

3. 关于渗水原因的鉴定与责任划分：

   • 法律背景：在解决渗水纠纷时，明确渗水原因是关键。这可能需要专业的鉴定机构进行鉴定，以确定渗水是由于建筑质量问题、维护不当还是其他原因导致。
   • 法律建议：您可以先尝试与对方协商，共同委托一家专业的鉴定机构进行鉴定。根据鉴定结果，再确定责任划分和维修方案。若协商不成，您可以在诉讼过程中申请法院委托鉴定机构进行鉴定，以作为判决的依据。

4. 预防与解决纠纷的建议：

   • 预防建议：为了避免类似的纠纷发生，建议在自建房时明确各部分的权属关系，并在合同或协议中详细约定维护责任和费用分担方式。
   • 解决建议：若纠纷已经发生，建议首先通过协商和调解的方式解决。若协商和调解无果，再考虑通过法律途径解决。在诉讼过程中，注意收集相关证据，如照片、视频、鉴定报告等，以支持自己的主张。

在处理此类纠纷时，务必保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益。 若您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。