在甲乙双方的合作协议书中，是否需要填写法定代理人，这主要取决于甲乙双方是否为完全民事行为能力人。以下是对这一问题的详细分析：

1. 完全民事行为能力人：

   • 如果甲乙双方都是完全民事行为能力人（即年满18周岁且精神健康状况正常，或虽未满18周岁但以自己的劳动收入为主要生活来源且精神健康状况正常），那么他们有权独立签订合作协议书，无需填写法定代理人。在这种情况下，合作协议书直接由甲乙双方签字或盖章即可生效。

2. 限制民事行为能力人或无民事行为能力人：

   • 如果甲乙双方中有一方或双方是限制民事行为能力人（如未成年人或精神健康状况部分受损的人）或无民事行为能力人（如精神病人或不能辨认自己行为的人），那么他们无法独立签订合作协议书。此时，需要由他们的法定代理人（如父母、监护人等）代为签订或同意签订合作协议书，并在协议书上注明法定代理人的身份和签字。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，限制民事行为能力人实施的纯获利益的民事法律行为或者与其年龄、智力、精神健康状况相适应的民事法律行为有效；实施的其他民事法律行为经法定代理人同意或者追认后有效。无民事行为能力人由其法定代理人代理实施民事法律行为。

3. 特殊情况：

   • 在某些特殊情况下，即使甲乙双方都是完全民事行为能力人，也可能因为特定原因（如一方因疾病或其他原因暂时无法行使民事权利）而需要法定代理人参与签订合作协议书。但这种情况较为罕见，且通常会在协议书中明确说明原因和法定代理人的身份。

建议：

• 在签订合作协议书前，务必确认甲乙双方的法律地位和民事行为能力。如果一方或双方是限制民事行为能力人或无民事行为能力人，务必确保有法定代理人的参与和同意。
• 为了避免未来可能出现的法律纠纷，建议在合作协议书中明确注明甲乙双方的法律地位和民事行为能力情况，以及法定代理人的身份和签字（如果需要的话）。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。