核心结论：若公证书仅列明银行金额而未列明证券公司转出情况，可通过补充公证、与相关方协商或通过法律途径解决，具体如下：

1. 补充公证
   首先，可以联系原公证机构，说明公证书内容存在遗漏（未涵盖证券公司转出记录），申请对原公证书进行补充公证。根据《公证法》第三十四条，当事人、公证事项的利害关系人认为公证书有错误的，可以向出具该公证书的公证机构提出复查；若遗漏内容属实，公证机构可出具补正公证书或补充说明，明确证券账户资金变动情况。
   操作建议：提供证券公司出具的交易流水、资金转出凭证等材料，协助公证机构核实事实，确保补充内容与原公证书形成完整证据链。

2. 与相关方协商解决
   若公证书用于特定交易（如遗产分配、财产分割），可主动与交易相对方沟通，说明证券账户资金转出的事实，并提供证券公司流水、转账记录等证据，争取对方认可未列明部分的真实性。若对方同意，可签订补充协议或书面确认文件，避免因公证书内容不全引发纠纷。
   风险提示：若对方拒绝认可，可能需通过法律程序解决，此时补充公证或法院调取证据的必要性会显著增加。

3. 通过法律途径完善证据
   若公证书内容遗漏导致权益受损（如继承纠纷中证券资金未被分配），可向法院提起诉讼，并在诉讼中申请法院调取证券账户交易记录，或要求公证机构出庭说明情况。根据《民事诉讼法》第六十七条，法院有权向有关单位和个人调查取证，证券公司作为第三方机构需配合提供数据。
   关键点：诉讼中需重点证明证券资金与公证事项的关联性（如属于同一财产主体、转出时间与公证事项时间重叠等），以推动法院采纳未列明部分的真实性。

延伸建议：

• 未来办理公证时，建议提前梳理所有相关财产（包括银行、证券、基金等），向公证机构提供完整清单，避免遗漏；
  
• 若涉及大额资金或复杂财产，可要求公证机构在公证书中注明“本公证仅涵盖列明财产，其他财产以实际为准”等兜底条款，降低后续风险。
  

如有具体案件细节（如公证书用途、证券转出时间等），可进一步向我说明，我会结合实际情况提供更精准的解决方案。