自然人和公司做生意，在符合相关法律法规的前提下，是合法有效的。以下从多个角度为您详细分析：
合法性依据
合同主体资格：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是民事主体之间设立、变更、终止民事法律关系的协议。自然人和公司均属于合法的合同主体，有权签订合同。
- 自然人需具备相应的民事行为能力，即能够理解合同内容并承担合同义务；公司则需具备合法的经营资格和相应的民事行为能力，如营业执照等。
合同形式与内容：
- 合同形式多样，可以是书面形式、口头形式或其他形式。书面形式包括合同书、信件、电报、电传、传真等，以及电子数据交换、电子邮件等能够有形地表现所载内容并可以随时调取查用的数据电文。
- 合同内容必须合法，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。例如，不得签订涉及非法交易、走私等违法活动的合同。
签订合同的注意事项
协商一致：
- 双方应基于真实意思表示，就合同的主要条款协商一致，不存在欺诈、胁迫等情形。这是合同成立并生效的重要前提。
核实对方资格：
- 在签订合同前，双方应核实对方的主体资格，确保对方具备签订合同的合法身份和权利。例如，自然人应确认公司是否具备合法的营业执照和经营资格；公司应确认自然人是否具备相应的民事行为能力。
明确合同内容：
- 合同应详细列明双方的权利和义务，包括标的物、价款、履行期限、违约责任等关键条款。这有助于避免合同履行过程中的纠纷和争议。
特定类型的合同
劳动合同：
- 如果自然人与公司之间建立的是劳动关系，那么应签订书面劳动合同，明确双方的权利义务。这是《中华人民共和国劳动合同法》的明确要求。
其他民事合同：
- 除劳动合同外，自然人与公司还可签订买卖合同、服务合同等其他类型的民事合同。这些合同同样需满足上述的合法性要求和注意事项。
特殊情况
- 在某些特殊行业或特定交易中，如金融、医疗、建筑等需要特定资质许可的领域，若自然人或公司不具备相应资质，可能导致合同部分条款无效甚至整个合同无效。例如，自然人与无建筑资质的公司签订的大型建筑工程施工合同，可能会因公司缺乏法定资质而被认定无效。
举例说明
以自然人李四与某科技公司签订的软件购买合同为例。李四作为具有支付软件费用能力和意愿的自然人，与具备从事软件开发和销售业务资质和能力的科技公司，在平等自愿的基础上就软件功能、价格、交付期限等事项达成一致并签署合同。此合同因双方主体资格合法、内容合法且经过协商一致，故受法律保护。
总结与建议：自然人和公司做生意是合法的，但双方在签订合同时应严格遵守相关法律法规和注意事项，以确保合同的合法性和有效性。如果您在签订或履行合同过程中遇到任何法律问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议和帮助。