农村自建房遭遇入户盗窃，应按以下步骤处理，我将从法律程序、证据收集、损失追偿、预防措施四个方面为你详细说明：

一、法律程序：立即报警并配合调查

1. 第一时间报警：无论损失金额大小，均应立即拨打110或到当地派出所报案。根据《刑事诉讼法》第110条，公安机关必须受理并开展侦查，这是启动刑事追责的关键步骤。
   
2. 配合制作笔录：详细陈述被盗经过、财物特征、嫌疑人特征（如身高、口音、逃跑方向等），这些信息可能成为破案线索。
   
3. 要求出具《受案回执》：这是证明你已报案的法定凭证，后续查询案件进展或申请赔偿时需使用。

二、证据收集：固定损失与现场痕迹

1. 保护现场：在警方到达前，不要随意翻动物品，避免破坏指纹、脚印等痕迹。可拍摄现场照片或视频，重点记录门窗破坏、财物丢失位置等。
   
2. 列明损失清单：详细记录被盗物品的名称、型号、购买时间、价格（附发票或收据），若无法提供凭证，可参考市场价或评估价值。
   
3. 调取周边监控：若自建房附近有公共摄像头或邻居家安装了监控，可向警方提供线索，协助调取录像。

三、损失追偿：刑事附带民事诉讼或单独起诉

1. 刑事追责：若嫌疑人被抓获，公安机关会移送检察院审查起诉。根据《刑法》第264条，入户盗窃可能面临3年以下有期徒刑、拘役或管制，情节严重者刑期更高。
   
2. 民事赔偿：
   
   • 刑事附带民事诉讼：在检察院提起公诉时，你可作为被害人提出赔偿请求，法院会一并审理。需提交损失清单、购买凭证等证据。
     
   • 单独民事诉讼：若刑事案件未追回财物，你可单独向法院起诉嫌疑人要求赔偿，需提供损失证明及刑事判决书（如有）。
     
3. 保险理赔：若你购买了家财险或盗窃险，可联系保险公司报案，按合同约定申请理赔。

四、预防措施：降低再次被盗风险

1. 加固门窗：安装防盗门、防盗窗，使用C级锁芯（抗技术开启时间≥1分钟），夜间可加装插销或报警器。
   
2. 安装监控：在院落、门口等位置安装摄像头，选择带夜视、移动侦测功能的设备，并确保存储时间足够（建议至少30天）。
   
3. 邻里守望：与邻居建立联系，互相留意异常情况，发现可疑人员及时报警或通知你。
   
4. 贵重物品保管：不要将大量现金、首饰等存放在家中，可存入银行保险箱或使用隐蔽保险柜。

若案件进展缓慢或赔偿未到位，可随时向我咨询具体应对策略。例如，如何申请补充侦查、如何提高民事赔偿成功率等，我会结合你的案件细节提供进一步建议。