结论前置：在遗产分割时，继承人之间的协议中指定房屋继承人是有效的，但这一有效性受到多个条件的制约。
详细分析：
主体适格：
- 签订遗产分割协议的继承人必须具备完全民事行为能力，即能够完全理解并承担自己行为所带来的法律后果。这通常指的是年满十八周岁且精神正常的成年人。若继承人中存在无民事行为能力人或限制民事行为能力人，他们签订的协议可能无效或效力待定，需经法定代理人追认才有效。
意思表示真实：
- 协议内容必须体现继承人的真实意愿，不存在欺诈、胁迫、重大误解等不正当手段干扰。例如，若继承人甲通过威胁伤害继承人乙的方式强迫其签订不公平的遗产分割协议，该协议可被撤销。在指定房屋继承人的情境中，所有继承人应自愿且明确地表示同意该指定。
内容合法：
- 协议内容不得违反国家法律法规的强制性规定，不得损害国家、集体和他人的合法权益，也不得违背社会公共利益和道德准则（公序良俗）。具体来说，协议应明确遗产的具体范围（包括房屋的具体信息）、分割方式等，且不得剥夺继承人的法定继承权或约定违法事项。例如，若协议中指定房屋继承人时，未考虑缺乏劳动能力又没有生活来源的继承人的必要继承份额，该部分约定可能无效。
形式符合要求：
- 法律对遗产分割协议的形式通常没有严格要求，书面或口头形式均可（但需有充分证据证明口头协议的存在）。然而，书面形式因其确定性和证据效力更强，在发生纠纷时更容易举证，因此更为推荐。在指定房屋继承人的协议中，建议采用书面形式，并由所有继承人签字确认，以明确各自的权利和义务。
其他注意事项：
- 公证与律师见证：为增强协议的法律效力和公众信任度，当事人可选择请律师见证或办理公证手续。经过公证的遗产分割协议在后续执行过程中若出现纠纷，更易被法院采信，从而更有效地保障各方合法权益。
- 债务承担：若被继承人留有债务未清偿，遗产分割协议应考虑债务的承担问题。在指定房屋继承人时，应明确该房屋是否涉及债务，以及债务如何承担，否则可能影响协议的效力。
举例说明：
假设张三去世后留下了一套房屋作为遗产，其有三个继承人：李四、王五和赵六。三人经过协商，签订了一份遗产分割协议，明确指定李四为房屋的继承人，同时约定王五和赵六放弃对该房屋的继承权，并由李四承担张三生前所欠的某笔债务。该协议若满足上述条件（主体适格、意思表示真实、内容合法、形式符合要求），则是有效的。
总结与建议：
在遗产分割时，继承人之间的协议中指定房屋继承人是有效的，但必须确保协议满足主体适格、意思表示真实、内容合法以及形式符合要求等条件。为避免潜在的法律风险和纠纷，建议在签订协议前充分了解相关法律法规，并考虑咨询专业律师（在此情况下，即直接向我咨询）以确保协议的合法性和有效性。