违法取水的水资源税计算需结合具体违法情形与法律规定综合判定，核心结论如下：

1. 违法取水情形下的水资源税计算逻辑
   根据《中华人民共和国水资源税改革试点实施办法》及地方配套规定，水资源税的计税依据为“实际取用水量”，但违法取水行为可能触发以下两种计算方式：

   • 正常计税+罚款：若仅存在未按规定申报、未安装计量设施等程序性违法，税务机关会按实际取水量（或推定水量）核定应纳税额，同时依据《税收征收管理法》处以罚款（如未缴税款50%至5倍的罚款）。
     
   • 加倍计税+罚款：若存在超计划取水、未经批准擅自取水等实质性违法，部分地方性法规（如《河北省水资源税改革试点实施办法》）明确规定“对超计划或超定额取水部分，按适用税额的2倍征收水资源税”，同时可能面临水利部门按《水法》第69条处以2万-10万元罚款。

2. 关键计算要素解析

   • 取水量核定：
     
     • 有计量设施的：按实际读数计算；
       
     • 无计量设施的：水利部门可按水泵额定流量×取水时间推定，或参考行业用水定额核定。
       
   • 税额标准：
     实行“分类分级”税额制，例如：
     
     • 地下水税额＞地表水；
       
     • 超采区税额＞非超采区；
       
     • 特种行业（如洗浴、洗车）税额＞普通行业。
       
   • 违法加成：
     部分省份对非法取水明确规定“加倍征收”，如内蒙古对未经批准取用地下水的，按税额标准的3倍计征。

3. 实务中的典型案例参考

   • 案例1：某企业未办理取水许可证擅自取用地下水10万立方米，当地地下水税额为2元/立方米。
     
     • 税务处理：按10万×2元=20万元计征；
       
     • 水利处罚：依据《水法》第69条处8万元罚款；
       
     • 若地方规定非法取水加倍征税，则需补缴20万×2=40万元。
       
   • 案例2：某农场超批准量取水5万立方米，地表水税额为0.5元/立方米。
     
     • 税务处理：正常部分按批准量计税，超量部分5万×0.5元×2倍=5万元；
       
     • 水利处罚：可能按超量部分处1万-5万元罚款。

建议行动：若涉及违法取水被追缴税款，需重点核查：

1. 水利部门认定的取水量是否准确（可要求提供流量监测记录或推定依据）；
   
2. 税额标准是否适用正确（如是否误将地表水按地下水标准征收）；
   
3. 是否存在重复处罚（如税务机关已加倍征税后，水利部门是否再次罚款）。
   

如有具体案件细节（如取水地点、用途、地方性法规等），可进一步向我咨询计算合规性及抗辩策略。