结论：在挂靠别人的公司去投标并打保证金的情况下，为了保障双方的权益，明确各自的责任与义务，建议签订一份详细的挂靠协议（或称为合作协议、合作合同）。以下是对该协议应包含的主要内容及注意事项的详细说明。
协议应包含的主要内容
双方基本信息：
- 明确挂靠方（即您）与被挂靠方（即对方公司）的名称、地址、法定代表人或负责人等基本信息。
挂靠事项：
- 详细描述挂靠的具体事项，包括但不限于投标的项目名称、地点、规模、投标保证金的金额及支付方式等。
双方权利与义务：
- 挂靠方：应明确您在投标过程中的具体职责，如准备投标文件、参与投标会议等；同时，也应明确您需承担的费用，如投标保证金、可能产生的其他费用等。
- 被挂靠方：应明确对方公司需提供的支持，如提供投标所需的资质文件、协助办理投标手续等；同时，也应明确对方公司在投标过程中的监督权和管理权。
保证金处理：
- 明确投标保证金的支付方式、支付时间、退还条件及退还时间等。特别是要约定在投标成功或失败后，保证金的退还流程和责任归属。
违约责任：
- 约定双方在违反协议约定时应承担的责任，包括但不限于违约金、赔偿损失等。这有助于在发生纠纷时，有明确的依据进行责任划分和赔偿计算。
争议解决方式：
- 约定双方在发生争议时的解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。这有助于在争议发生时，快速有效地解决问题，避免纠纷扩大化。
其他条款：
- 根据实际情况，还可以约定其他需要明确的条款，如保密条款、协议变更与解除条件等。
注意事项
协议合法性：
- 确保协议内容合法合规，不违反国家法律法规的强制性规定。特别是要注意避免涉及非法挂靠、行贿受贿等违法行为。
协议明确性：
- 协议内容应明确具体，避免使用模糊、歧义的表述。这有助于在履行协议过程中，减少因理解不一致而产生的纠纷。
协议签署与保管：
- 协议应由双方签字或盖章确认，并各自保留一份原件。这有助于在发生纠纷时，提供有效的证据支持。
风险防控：
- 在签订协议前，应对被挂靠方的资质、信誉等进行充分调查，以降低合作风险。同时，在协议履行过程中，也应保持警惕，及时发现并解决问题。
建议：在签订挂靠协议前，最好咨询专业律师的意见，以确保协议内容合法合规、明确具体，并充分保障您的权益。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会尽我所能为您提供专业的法律服务。