针对您提出的“对无证经营的公司应如何处理”的问题，以下是根据《无证无照经营查处办法》及相关法律法规的详细解答：
一、查处主体与职责
县级以上地方人民政府：负责组织、协调本行政区域的无证无照经营查处工作，建立有关部门分工负责、协调配合的工作机制。
查处部门：包括工商行政管理部门以及法律、法规、国务院决定规定的部门和省、自治区、直辖市人民政府确定的部门。这些部门应当依法履行职责，密切协同配合，利用信息网络平台加强信息共享。
二、查处措施
责令停止经营活动：对于涉嫌无证经营的公司，查处部门有权责令其立即停止相关经营活动。
调查了解情况：查处部门可以向与涉嫌无证经营有关的单位和个人调查了解有关情况，包括经营活动的性质、范围、时间等。
现场检查与查封扣押：查处部门有权进入涉嫌从事无证经营的场所实施现场检查，并可以查封涉嫌用于无证经营的工具、设备、原材料、产品（商品）等物品。
查阅复制资料：查处部门可以查阅、复制与涉嫌无证经营有关的合同、票据、账簿以及其他有关资料，以便进一步调查取证。
三、处罚措施
无证经营处罚：从事无证经营的，由查处部门依照相关法律、法规的规定予以处罚。这可能包括罚款、没收违法所得、责令停业整顿等措施。
无照经营处罚：如果公司未依法取得营业执照从事经营活动，由工商行政管理部门依照相关法律、行政法规的规定予以处罚。法律、行政法规对无照经营的处罚没有明确规定的，由工商行政管理部门责令停止违法行为，没收违法所得，并处1万元以下的罚款。
提供便利条件处罚：明知属于无照经营而为经营者提供经营场所，或者提供运输、保管、仓储等条件的，由工商行政管理部门责令停止违法行为，没收违法所得，可以处5000元以下的罚款。
信用记录与公示：任何单位或者个人从事无证无照经营的，由查处部门记入信用记录，并依照相关法律、法规的规定予以公示。这将对公司的信誉和声誉造成严重影响。
四、其他注意事项
举报机制：任何单位或者个人有权向查处部门举报无证无照经营。查处部门应当向社会公开受理举报的电话、信箱或者电子邮件地址，并安排人员受理举报，依法予以处理。
查处与引导相结合：查处部门在依法查处无证无照经营时，应当坚持查处与引导相结合、处罚与教育相结合的原则。对于具备办理证照的法定条件、经营者有继续经营意愿的，应当督促、引导其依法办理相应证照。
法律责任：妨害查处部门查处无证无照经营，构成违反治安管理行为的，由公安机关依照《中华人民共和国治安管理处罚法》的规定予以处罚。构成犯罪的，依法追究刑事责任。
综上所述，对于无证经营的公司，查处部门将依法采取一系列措施进行查处和处罚。因此，建议公司在开展经营活动前务必依法取得相关证照，确保合法合规经营。