针对某单位诽谤自然人的情况，处理方式主要可以从民事、行政和刑事三个角度进行，具体如下：
民事途径：
- 名誉权侵权诉讼：根据《民法典》的相关规定，自然人享有名誉权，任何组织或个人不得以侮辱、诽谤等方式侵害其名誉权。若单位诽谤自然人，自然人可以向法院提起名誉权侵权诉讼，要求单位停止侵害、恢复名誉、消除影响、赔礼道歉，并可以要求赔偿因诽谤行为造成的经济损失和精神损害。
- 赔偿范围：赔偿范围通常包括直接经济损失（如因诽谤导致的收入减少、治疗费用等）和合理费用支出（如律师费、公证费等），以及精神损害赔偿，具体数额需根据案件具体情况和法院判决确定。
行政途径：
- 向相关部门投诉：自然人可以向网信、公安等部门投诉单位的诽谤行为。这些部门会根据具体情况进行调查处理，可能采取警告、罚款等行政处罚措施。例如，如果诽谤行为是通过网络进行的，网信部门可以要求网站删除相关诽谤信息，并对网站进行处罚；如果诽谤行为情节严重，公安机关可以依据《治安管理处罚法》对单位或相关责任人进行行政处罚。
刑事途径：
- 诽谤罪：虽然诽谤罪一般针对自然人，但如果单位的诽谤行为情节严重，如捏造事实诽谤他人，且造成严重后果（如导致被害人自杀、精神失常等），则可能构成诽谤罪。此时，自然人可以向公安机关报案，要求追究单位的刑事责任。根据《刑法》的规定，以暴力或者其他方法公然侮辱他人或者捏造事实诽谤他人，情节严重的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利。
- 单位犯罪处理：在特定情形下，单位也可构成诽谤罪的主体。对单位判处罚金，并对直接负责的主管人员和其他直接责任人员按自然人犯诽谤罪的标准处罚。但这种情况较为罕见，通常需要诽谤行为严重危害社会秩序和国家利益。
在处理此类案件时，自然人还需要注意以下几点：
- 证据收集：及时收集并保存与诽谤行为相关的证据，如网络言论的截屏、录屏、公证，书面材料的收集，以及证人证言等。这些证据是后续法律程序的关键。
- 初步协商：在提起诉讼或投诉前，可以尝试与单位进行协商，要求其停止侵害、澄清事实、消除影响。如果协商无果，再考虑采取法律途径。
- 法律程序：了解并遵循相关的法律程序，如民事诉讼的起诉、审理、判决等流程，以及行政投诉和刑事报案的程序要求。
示例说明：
假设某公司通过网络发布虚假信息，诽谤某自然人存在违法行为，导致该自然人名誉受损、收入减少。此时，该自然人可以：
- 收集并保存相关证据，如网络言论的截屏、录屏等；
- 尝试与公司进行协商，要求其删除虚假信息、公开道歉并赔偿损失；
- 如果协商无果，可以向网信部门投诉，要求网站删除相关诽谤信息，并对公司进行处罚；
- 同时，也可以向法院提起名誉权侵权诉讼，要求公司停止侵害、恢复名誉、消除影响、赔礼道歉，并赔偿经济损失和精神损害；
- 如果诽谤行为情节严重，如导致该自然人精神失常或自杀等严重后果，还可以向公安机关报案，要求追究公司的刑事责任。
最后，建议自然人在处理此类案件时，务必保持冷静、理性，依法维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。