严重超载发生交通肇事罪并非一定不能不起诉，是否起诉需根据具体案件情况，结合法律规定和司法实践综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、法律规定与起诉条件
交通肇事罪的构成：
- 根据《中华人民共和国刑法》第一百三十三条，违反交通运输管理法规，因而发生重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失的，构成交通肇事罪。超载是违反交通运输管理法规的行为之一，若因超载导致交通事故并满足上述构成要件，则可能构成交通肇事罪。
起诉的条件：
- 刑事案件的起诉需满足有犯罪事实、需要追究刑事责任等条件。对于交通肇事罪，若犯罪事实清楚，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任，则检察机关会提起公诉。
二、超载在交通肇事中的影响及不起诉的可能性
超载作为加重处罚情节：
- 超载行为本身可能增加交通事故的发生概率和严重程度。在交通肇事罪中，若存在超载等违反交通运输管理法规的情节，可能会作为加重处罚的因素考虑。但这并不意味着只要超载就一定会被起诉，还需综合考虑事故责任、损害后果、行为人主观过错等多方面因素。
不起诉的可能性及情形：
- 法定不起诉：若行为人没有犯罪事实，或符合《刑事诉讼法》规定的不予追究刑事责任的情形（如情节显著轻微、危害不大等），则可能作出法定不起诉决定。例如，如果超载行为并未直接导致事故发生，或者事故后果极其轻微，可能符合法定不起诉的条件。
- 酌定不起诉：对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的情形，检察机关可酌情作出不起诉决定。例如，行为人超载但事故责任较轻，且积极赔偿损失、取得被害人谅解，或者具有自首、立功等从轻、减轻处罚情节，可能影响起诉决定。
- 证据不足不起诉：若经补充侦查后仍认为证据不足，不符合起诉条件的，检察机关应作出不起诉决定。这要求检察机关在审查案件时，必须确保证据确实、充分，能够形成完整的证明体系。
三、实际案例与司法实践
- 在司法实践中，存在因超载引发交通肇事罪但最终未被起诉的案例。这些案例通常具备以下特点：一是超载行为与事故发生之间的因果关系不直接或不明显；二是行为人具有自首、立功、积极赔偿等从轻、减轻处罚情节；三是事故后果相对较轻，未造成严重的人员伤亡或财产损失。
四、建议与注意事项
及时咨询专业律师：
- 如果你或你身边的人因严重超载发生交通肇事罪，建议及时咨询专业律师，了解案件的具体情况和可能的法律后果。律师可以根据案件事实和法律规定，为你提供专业的法律意见和辩护策略。
积极配合调查与赔偿：
- 在案件处理过程中，应积极配合公安机关的调查工作，如实陈述事实经过。同时，如果可能的话，应积极赔偿被害人的损失，争取取得被害人的谅解。这有助于减轻你的法律责任，并可能影响检察机关的起诉决定。
关注证据收集与保全：
- 在案件处理过程中，应关注证据的收集与保全工作。确保所有与案件相关的证据都得到妥善保存和呈现，以便在需要时能够支持你的辩护主张。
总之，严重超载发生交通肇事罪并非一定不能不起诉。是否起诉需根据具体案件情况、法律规定和司法实践综合判断。如果你或你身边的人面临此类问题，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律帮助。