核心结论：集体土地被个人栽树苗，需根据具体情况判断个人行为是否合法，再采取相应措施，包括协商、要求停止侵害、向相关部门反映或通过法律途径解决。以下是具体分析：

一、判断个人栽树苗行为的合法性

1. 若个人经合法程序取得土地使用权
   • 如果个人通过承包、租赁等合法方式从集体组织取得了该集体土地的使用权，并且在承包或租赁合同中明确约定了可以在该土地上进行植树等农业生产经营活动，那么个人栽树苗的行为是合法的。在这种情况下，集体组织或其他成员一般无权干涉其正常的植树行为。
2. 若个人未经合法程序取得土地使用权
   • 若个人未经集体组织同意，也未通过任何合法途径获得土地使用权，擅自在集体土地上栽树苗，这种行为属于非法占用土地。根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，对符合土地利用总体规划的，没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处罚款；对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

二、针对不同情况的应对措施

1. 合法使用情况下的协调处理
   • 协商沟通：如果个人栽树苗行为合法，但可能对集体土地的其他用途或集体成员的利益产生一定影响，集体组织可以与个人进行协商沟通。例如，若植树行为影响了集体规划的灌溉渠道或道路通行，集体组织可以与个人协商调整植树位置或采取其他补救措施，以平衡个人利益和集体利益。
   • 合同约定调整：若个人是基于承包或租赁合同取得土地使用权进行植树，但实际情况发生变化，需要调整植树规模、树种等，集体组织可以与个人按照合同约定的程序进行协商，对合同内容进行变更或补充。
2. 非法使用情况下的处理方式
   • 要求停止侵害：集体组织发现个人非法在集体土地上栽树苗后，应首先要求个人立即停止侵害行为，限期自行清除树苗，恢复土地原状。可以通过书面通知或口头告知的方式向个人传达这一要求，并保留相关证据，如通知的送达回执、现场照片等。
   • 向相关部门反映：如果个人拒绝停止侵害行为，集体组织可以向当地的乡镇人民政府、县级以上人民政府自然资源主管部门等相关部门反映情况。这些部门有权对非法占用土地的行为进行调查和处理，集体组织应积极配合相关部门的调查工作，提供必要的证据和信息。
   • 提起民事诉讼：若个人的非法植树行为给集体土地造成了损害，导致集体经济损失，集体组织可以向人民法院提起民事诉讼，要求个人赔偿损失。在诉讼过程中，集体组织需要提供充分的证据证明个人的侵权行为、损害结果以及两者之间的因果关系，如土地评估报告、现场勘验记录等。
   • 涉及犯罪的刑事举报：如果个人的非法占用土地行为情节严重，构成犯罪的，集体组织可以向公安机关举报，由公安机关依法立案侦查，追究个人的刑事责任。例如，个人非法占用基本农田五亩以上或者基本农田以外的耕地十亩以上的，就可能涉嫌非法占用农用地罪。