结论：伤情鉴定机构将一根肋骨骨折和三根不全性骨折认定为轻微伤，在大部分情况下是合法的，但具体还需结合骨折的详细情况、并发症以及相关法律法规进行综合判断。
一、法律法规依据
根据《人体损伤程度鉴定标准》，轻伤与轻微伤的界定主要依据损伤的严重程度及其后果。对于肋骨骨折而言，轻伤二级的标准通常要求肋骨骨折2处以上，并且可能伴有其他严重并发症。而单纯一根肋骨骨折，在无其他严重并发症的情况下，通常被认定为轻微伤。
二、肋骨骨折的伤情鉴定
骨折数量与位置：
- 一根肋骨骨折，在无其他严重并发症的情况下，通常被认定为轻微伤。
- 三根不全性骨折，如果骨折程度较轻，未造成明显的功能障碍或并发症，也可能被认定为轻微伤。然而，如果这三根不全性骨折接近完全性骨折，或者存在潜在的并发症风险，鉴定机构可能会进行更详细的评估。
并发症情况：
- 如果一根肋骨骨折或三根不全性骨折合并了严重的并发症，如气胸、血胸等，且这些并发症需要手术或胸腔置管引流等治疗，那么伤情等级可能会相应提升，有可能被认定为轻伤甚至更严重的等级。
骨折类型与稳定性：
- 骨折的类型（如线性骨折、粉碎性骨折）和稳定性也会影响伤情鉴定。粉碎性骨折或移位明显的骨折更可能导致功能障碍，从而影响伤情等级的评定。
三、鉴定机构的专业性与综合性
伤情鉴定是一个严谨且专业的过程，需要由具有法医学鉴定资格的人员进行。他们会综合受伤的原因、经过、损伤细节、临床表现、影像学检查结果以及后续恢复情况等多方面因素，来最终确定损伤程度。因此，在具体案件中，应依据专业人员的鉴定结论来确定伤情等级。
四、特殊情况下的考虑
- 个体差异：不同个体的身体状况和恢复能力存在差异，这可能影响伤情的最终评定。例如，老年人或患有基础疾病的人可能恢复较慢，伤情可能相对更重。
- 鉴定时机：伤情鉴定应在伤情稳定后进行，以确保鉴定结果的准确性。如果鉴定时机过早或过晚，可能影响伤情的评定。
五、建议与注意事项
- 选择正规鉴定机构：确保鉴定机构具有相关资质和经验，以保证鉴定结果的准确性和权威性。
- 提供完整医疗证据：包括病历资料、影像学报告等，以便鉴定机构全面了解伤情。
- 了解鉴定程序：遵循相关的法律法规和鉴定程序，确保自己的权益得到保障。
- 如有异议，及时沟通：如果对鉴定结果有异议，应及时与鉴定机构沟通并寻求法律援助。
总结：伤情鉴定机构将一根肋骨骨折和三根不全性骨折认定为轻微伤，在大部分情况下是合法的。但具体还需结合骨折的详细情况、并发症以及相关法律法规进行综合判断。如果您对鉴定结果有异议或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。