两个不同的单位确实可以一起立项工程，这在法律上被称为联合体投标或合作建设。以下从不同角度对此进行详细分析：
一、法律基础与规定
《中华人民共和国招标投标法》：该法允许两个以上法人或者其他组织组成一个联合体，以一个投标人的身份共同投标。联合体各方均应当具备承担招标项目的相应能力，并签订共同投标协议，明确约定各方拟承担的工作和责任，以及联合体成员之间的权利义务关系。
《中华人民共和国建筑法》：虽然该法未直接规定联合体投标，但规定了建筑工程的发包单位与承包单位应当依法订立书面合同，明确双方的权利和义务。在联合体投标的情况下，这一原则同样适用，即联合体各方需要与发包单位签订合同，并明确各自的责任和义务。
二、实际操作与注意事项
联合体协议：两个单位在共同立项工程前，应签订详细的联合体协议。协议中应明确各自的工作范围、责任分配、利益分配、争议解决机制等关键条款。这有助于确保双方在项目实施过程中有明确的指导和约束，减少潜在的法律纠纷。
资质与能力：联合体各方均应具备承担招标项目的相应能力。这包括技术实力、资金实力、管理经验等方面。如果某一单位在某方面存在不足，可能会影响整个联合体的投标资格或项目实施效果。
责任承担：在联合体投标中，联合体各方对发包单位承担连带责任。这意味着如果某一单位未能履行其义务，发包单位有权要求联合体中的任何一方承担全部责任。因此，在选择合作伙伴时，应谨慎评估对方的信誉和实力。
三、可能的风险与防范
法律风险：如果联合体协议签订不当或执行不力，可能会导致法律纠纷。例如，协议中未明确责任分配或利益分配机制，可能导致双方在项目实施过程中产生争议。为防范此类风险，建议在签订协议前咨询专业律师，确保协议内容合法、有效且具有可操作性。
合作风险：联合体各方在合作过程中可能因文化差异、管理风格不同等原因产生摩擦。为降低合作风险，建议在项目实施前进行充分的沟通和协调，建立有效的沟通机制和合作流程。
总结与建议：两个不同的单位可以一起立项工程，但需要签订详细的联合体协议，明确各自的责任和义务。在选择合作伙伴时，应谨慎评估对方的资质、能力和信誉。在项目实施过程中，应建立有效的沟通机制和合作流程，以降低潜在的法律风险和合作风险。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。