结论：诈骗金额达到两千元且自首的情况下，手机是否会被没收需根据具体情况判断，但自首本身不会直接导致手机被没收，手机是否被没收主要取决于其是否被认定为作案工具或涉案财物。
分析说明：
自首的法律后果：
- 自首是刑法中的一个重要情节，根据《中华人民共和国刑法》第六十七条的规定，犯罪以后自动投案，如实供述自己的罪行的，是自首。对于自首的犯罪分子，可以从轻或者减轻处罚。其中，犯罪较轻的，可以免除处罚。
- 自首本身并不会直接导致个人财物的没收，它主要影响的是对犯罪分子的量刑。
手机是否会被没收：
- 手机是否会被没收，主要取决于其是否被认定为作案工具或涉案财物。如果手机是用于实施诈骗行为的工具，或者手机内存有与诈骗行为直接相关的证据，那么手机有可能会被公安机关依法扣押或没收。
- 如果手机与诈骗行为无直接关联，或者虽然有关联但并非作案工具（例如，只是用于日常通讯，并未直接用于诈骗），那么手机通常不会被没收。
诈骗金额的影响：
- 诈骗金额达到两千元，已经构成了诈骗罪的立案标准（具体标准可能因地区而异，但两千元通常是一个相对较低的门槛）。然而，诈骗金额的大小主要影响的是对犯罪分子的量刑，而不是直接决定手机是否会被没收。
特殊场景：
- 在实际操作中，如果手机被认定为涉案财物或作案工具，公安机关会依法进行扣押，并在案件审理结束后，根据法院的判决来决定是否没收。如果手机并非涉案财物或作案工具，或者法院判决不予没收，那么手机将会被返还给所有人。
后续行动建议：
- 如果你或你认识的人涉及此类情况，建议积极配合公安机关的调查，如实陈述事实，提供相关证据。
- 同时，可以咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及案件的可能走向和法律后果。律师可以根据具体情况，为你提供更具体的法律建议和帮助。
法律背景：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，公安机关在侦查活动中发现的可用以证明犯罪嫌疑人有罪或者无罪的各种财物、文件，应当查封、扣押；与案件无关的财物、文件，不得查封、扣押。
- 对于被扣押的财物、文件，如果经查明确实与案件无关的，应当在三日以内解除查封、扣押，退还原主。
如果有任何其他法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。