返还履约保证金和上缴扣除款一般没有法定的时间先后顺序，具体需根据合同约定和实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定优先
   如果合同中明确约定了返还履约保证金和上缴扣除款的时间节点或先后顺序（例如“先返还保证金，再处理扣除款”或“扣除款上缴后X日内返还保证金”），则双方应严格按照合同履行。此时，时间顺序以合同条款为准，任何一方违反约定均可能构成违约。

2. 合同未约定或约定不明时
   若合同未对时间顺序作出明确规定，需结合以下因素综合判断：

   • 交易习惯：若行业或双方过往交易中存在普遍认可的顺序（如先结算扣除款再退还剩余保证金），可参照习惯处理。
     
   • 公平原则：若扣除款涉及违约赔偿或损失抵扣，可能需先核定扣除金额后，再返还剩余保证金；若两者无直接关联（如保证金与扣除款分属不同合同义务），则可能并行处理或按实际履行情况确定顺序。
     
   • 实际履行情况：若一方已实际履行部分义务（如已上缴扣除款），可主张对方同步履行返还义务，避免因顺序争议导致利益失衡。

3. 法律风险提示

   • 若扣除款存在争议（如对方主张的扣除金额不合理），需先通过协商、仲裁或诉讼确认扣除范围后，再处理保证金返还问题，否则可能因扣除款未定导致保证金返还金额不确定。
     
   • 若一方拖延履行义务（如拒不上缴扣除款或拒不返还保证金），另一方可依据《民法典》第577条要求其承担违约责任，包括继续履行、赔偿损失等。

建议：

• 优先审查合同条款，明确双方权利义务；
  
• 若合同无约定，及时与对方协商补充协议或留存书面沟通记录（如邮件、微信），固定履行顺序；
  
• 涉及争议时，可委托律师介入，通过法律程序维护权益。
  

如有具体合同或案例细节，可进一步向我咨询，我会结合实际情况提供针对性分析。