结论是：修理厂将车违停被罚款，一般情况下应由实际实施违停行为的主体承担罚款，具体分析如下：

1. 若违停行为由修理厂员工直接实施
   根据《行政处罚法》及相关交通法规，行政处罚的对象是违法行为人。若修理厂员工在执行工作任务（如移动车辆、试车等）过程中违停，此时员工的行为属于职务行为。根据《民法典》第1191条，用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任。虽然交通罚款属于行政处罚而非民事赔偿，但实践中行政机关通常会直接处罚实际违停人（即员工），但修理厂作为用人单位，若员工行为系职务行为，修理厂可能需通过内部管理承担最终责任（如报销罚款、对员工追责等）。若员工个人行为与工作无关（如私自开车违停），则由员工个人承担罚款。

2. 若违停行为由车主自行实施，但车辆在修理厂控制下
   若车主在取车前自行驾驶车辆违停（如试车未归），此时违法行为人是车主，罚款应由车主承担。但修理厂需注意：若车辆在修理厂控制期间（如未交付车主），修理厂有保管义务，若因保管不善导致车主违停（如未锁车导致他人驾驶违停），修理厂可能需承担部分责任，但交通罚款本身仍针对实际违停人。

3. 特殊情形：修理厂授权或指示他人违停
   若修理厂明确授权或指示第三方（如外包运输人员）违停，则修理厂作为指示方可能被认定为共同违法行为人，需与实际违停人承担连带责任。

建议：

• 修理厂应加强内部管理，明确员工职责，避免因职务行为导致违停；
  
• 若车辆在修理期间需移动，应提前规划合法停车区域；
  
• 发生罚款后，修理厂可与车主协商责任分担，但最终需以行政机关的处罚对象为准。
  

如有进一步细节（如违停具体情形、车辆控制权归属等），可继续向我咨询，我会结合具体证据为您分析责任划分。