结论前置：公司就社保补偿款问题去法院起诉是否有效果，需分情况讨论，具体如下：

1. 若公司已合法支付社保补偿款，员工无理索要或拒绝履行相关义务
   若公司已按照法律规定或双方约定，足额支付了社保补偿款（如经济补偿金、社保补缴差额等），但员工仍无理索要更多款项，或拒绝配合办理社保转移、离职手续等，公司可通过起诉要求员工返还多收款项、履行配合义务或确认双方权利义务关系。此时，法院会依据事实和法律进行裁判，公司的诉求若合法有据，通常会得到支持，因此起诉是有效的维权方式。

2. 若公司未依法支付社保补偿款，员工起诉公司后公司反诉或应诉
   若公司未依法为员工缴纳社保或未支付应给的社保补偿款（如未支付经济补偿金、未补缴社保等），员工可能先起诉公司要求支付。此时，公司若认为员工诉求不合理（如补偿标准过高、已履行部分义务等），可在应诉时提出抗辩，或反诉员工存在过错（如未提前通知离职、违反公司规章制度等）。但需注意，若公司确实存在违法情形（如未缴社保），法院通常会判决公司补缴或支付补偿款，公司反诉或抗辩的效果可能有限，除非能证明员工存在重大过错或补偿标准明显不合理。

3. 若双方对社保补偿款的金额、支付方式等存在争议
   若双方对社保补偿款的金额、支付时间、支付方式等存在争议（如公司认为已支付但员工否认、员工认为补偿标准过低等），公司可通过起诉要求确认双方权利义务关系或要求员工履行相关义务（如签署离职协议、配合办理社保转移等）。此时，法院会依据双方提供的证据（如工资记录、社保缴纳记录、离职协议等）进行裁判，若公司证据充分、诉求合理，起诉通常能有效解决争议。

建议：

• 公司若考虑起诉，需先收集并整理相关证据（如社保缴纳记录、工资单、离职协议、沟通记录等），以证明自身主张的合法性。
  
• 起诉前可尝试与员工协商解决，若协商无果再通过法律途径维权，以节省时间和成本。
  
• 若对法律程序或证据收集不熟悉，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细指导。