农户房屋倒塌后两年内申请重建，主要依据《中华人民共和国土地管理法》及地方性法规、规章的相关规定。具体分析如下：

1. 《中华人民共和国土地管理法》的核心规定
   根据《土地管理法》第六十二条，农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。房屋倒塌后，农户若需在原宅基地上重建，需符合以下条件：

   • 符合土地利用总体规划：重建需在乡（镇）土地利用总体规划确定的村庄、集镇建设用地范围内进行；
     
   • 权属合法：原宅基地使用权需经依法登记或确认，无权属争议；
     
   • 面积合规：重建后的房屋面积不得超过当地规定的标准。
     若涉及占用农用地，还需依法办理农用地转用审批手续。

2. 地方性法规及规章的补充规定
   各地可能根据实际情况制定具体实施细则，例如：

   • 重建申请时限：部分省份（如浙江、广东）在《农村宅基地管理办法》中明确，房屋倒塌后，农户应在一定期限内（通常为1-2年）提出重建申请，逾期未申请的，宅基地可能由村集体收回；
     
   • 审批流程：需向乡镇人民政府提交申请，经县级自然资源部门审核后，由县级人民政府批准；
     
   • 特殊情形处理：如因自然灾害导致房屋倒塌，部分地区可能简化审批流程或提供重建补贴。

3. 实务操作建议

   • 及时申请：农户应在房屋倒塌后尽快向村委会提出重建申请，避免因超期丧失宅基地使用权；
     
   • 材料准备：需提交身份证明、宅基地使用权证、房屋倒塌证明（如村委会或乡镇政府出具的证明）等材料；
     
   • 合规建设：重建需符合当地规划要求，不得擅自扩大面积或改变用途，否则可能面临拆除风险。

若涉及具体操作或地方政策差异，可进一步向我咨询，我将结合您所在省份的法规提供针对性解答。