合同违约金通常是不可以开具增值税专用发票的。以下是对这一问题的详细分析：

一、政策依据

根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第六条及其实施细则第十二条的规定，销售额是纳税人销售货物或者应税劳务向购买方收取的全部价款和价外费用。但《中华人民共和国增值税暂行条例实施细则》第十二条也明确将某些特定项目排除在价外费用之外，其中就包括“因违约而支付的违约金”。

二、原因解析

1. 非应税行为：

   • 违约金是合同一方因未履行合同义务或履行不符合约定而向另一方支付的赔偿。它并不构成销售货物或提供应税劳务的对价，因此不属于增值税的征税范围。
   • 既然违约金不属于增值税的征税范围，那么自然就不应开具增值税专用发票。

2. 避免重复征税：

   • 如果允许对违约金开具增值税专用发票，购买方在抵扣进项税额时可能会产生重复抵扣的问题。这会导致税收的不公平，因为违约金本身并不是销售货物或提供应税劳务的报酬。

3. 税务管理需要：

   • 税务机关需要对发票的使用进行严格管理，以确保税收的准确征收和防止税收流失。
   • 将违约金纳入增值税专用发票的开具范围，可能会增加税务管理的难度和风险，因为违约金的支付往往与合同履行情况紧密相关，且可能涉及复杂的法律纠纷。

三、实际操作建议

• 在实际业务中，如果发生违约金支付的情况，建议双方通过协商确定支付方式和凭证类型。通常，违约金支付可以通过银行转账、支票等方式进行，并附上相关的合同、协议或法院判决书等作为支付凭证。
• 如果确实需要开具发票作为凭证，可以考虑开具普通发票（如收据等），但需注意普通发票与增值税专用发票在税务处理上的区别。

综上所述，合同违约金通常是不可以开具增值税专用发票的。这一规定是基于税收政策、避免重复征税以及税务管理需要的综合考虑。在实际操作中，建议双方根据具体情况协商确定支付方式和凭证类型。