关于芥菜种子集采种植是否合法的问题，这主要取决于具体的采集行为是否符合国家关于农作物种质资源保护的相关法律法规。

首先，我们需要明确的是，国家依法保护种质资源，任何单位和个人都不得侵占和破坏种质资源，同时禁止采集或者采伐国家重点保护的天然种质资源。这是基于《中华人民共和国种子法》第八条的明确规定。如果因科研等特殊情况需要采集或者采伐国家重点保护的天然种质资源，那么必须经过国务院或者省、自治区、直辖市人民政府的农业、林业主管部门的批准。

对于芥菜种子而言，如果它属于国家重点保护的天然农作物种质资源，那么未经批准的集采种植行为就是违法的。这种违法行为可能会面临县级以上人民政府农业、林业主管部门的责令停止违法行为、没收种质资源和违法所得，并处五千元以上五万元以下罚款的处罚。如果造成损失，还需要依法承担赔偿责任。

另外，从地方性法规的角度来看，如《甘肃省农作物种子条例(修订草案)》就明确提出了禁止采集天然农作物种质资源，除非因科研等特殊情况并经过相关部门的批准。这进一步强调了国家对农作物种质资源保护的严格态度。

因此，对于芥菜种子的集采种植行为，如果未经相关部门批准，且芥菜种子属于国家重点保护的天然农作物种质资源，那么这种行为就是违法的。为了确保合法合规，建议您在进行芥菜种子集采种植前，先了解清楚芥菜种子是否属于国家重点保护的天然农作物种质资源，并咨询当地农业、林业主管部门，了解是否需要办理相关批准手续。

总的来说，保护农作物种质资源是国家的重要政策，任何单位和个人都应严格遵守相关法律法规，共同维护国家的种质资源安全。