交通事故司法鉴定并非一定不能在本市自治区进行，这主要取决于具体的鉴定需求和本市自治区内鉴定机构的资质与能力。以下从几个方面为你详细分析：

1. 鉴定机构资质与范围：

   • 交通事故司法鉴定通常涉及车辆性能、事故成因、伤情鉴定等多个方面。这些鉴定需要由具备相应资质和专业的鉴定机构来完成。
   • 如果本市自治区内有具备相关资质和能力的鉴定机构，那么当然可以在本市自治区内进行司法鉴定。这些机构通常经过相关部门的认证和授权，能够提供准确、可靠的鉴定结果。

2. 鉴定需求与复杂性：

   • 交通事故的复杂性和多样性决定了鉴定需求的多样性。有些简单的交通事故可能只需要进行基本的车辆性能鉴定或伤情鉴定，这些鉴定在本市自治区内通常可以完成。
   • 然而，对于一些复杂或特殊的交通事故，如涉及高科技车辆、特殊路况或复杂事故成因的，可能需要更高级别的鉴定机构或专家来进行鉴定。在这种情况下，如果本市自治区内的鉴定机构无法满足需求，那么可能需要寻求其他地区的鉴定机构或专家。

3. 法律程序与规定：

   • 在进行交通事故司法鉴定时，需要遵循一定的法律程序和规定。这些程序和规定可能因地区而异，但通常都要求鉴定机构具备相应的资质和认证。
   • 如果本市自治区内的鉴定机构符合相关法律程序和规定的要求，并且能够满足鉴定需求，那么就可以在本市自治区内进行司法鉴定。

4. 实际操作中的考虑：

   • 在实际操作中，除了考虑鉴定机构的资质和能力外，还需要考虑鉴定费用、时间成本等因素。如果本市自治区内的鉴定机构能够提供合理且高效的鉴定服务，那么选择在本市自治区内进行鉴定可能更为合适。
   • 另外，如果交通事故涉及多方当事人或跨地区的情况，可能还需要考虑鉴定结果的认可度和执行问题。在这种情况下，选择具有广泛认可度和执行力的鉴定机构可能更为重要。

建议：

• 在进行交通事故司法鉴定前，建议先了解本市自治区内鉴定机构的资质和能力情况，以及相关法律程序和规定的要求。
• 如果本市自治区内的鉴定机构无法满足需求或存在不确定性因素，可以考虑寻求其他地区的鉴定机构或专家进行鉴定。
• 在选择鉴定机构时，除了考虑资质和能力外，还需要综合考虑鉴定费用、时间成本等因素，以及鉴定结果的认可度和执行问题。

如果你在交通事故司法鉴定方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。