由主管部门起诉的案子并不一定就是刑事案件，这取决于主管部门起诉的具体性质和所依据的法律条款。以下从几个角度进行详细分析：

1. 主管部门的性质与起诉类型：

   • 主管部门，如市场监管部门、税务部门等，它们通常负责特定领域的行政管理和执法。当这些部门发现违法行为时，它们可能会根据相关法律法规提起行政诉讼或行政处罚，而非刑事诉讼。
   • 刑事诉讼通常由公安机关、检察机关等司法机关提起，针对的是违反刑法的犯罪行为。

2. 起诉的法律依据：

   • 如果主管部门起诉的依据是行政法规或规章，那么该案件更可能属于行政案件，而非刑事案件。例如，市场监管部门对违反市场监管法规的企业提起诉讼，这通常属于行政诉讼范畴。
   • 如果主管部门在执法过程中发现犯罪行为，并依据刑法相关规定将案件移送至司法机关（如公安机关或检察机关），那么该案件将进入刑事诉讼程序。但此时，起诉的主体已经转变为司法机关，而非原主管部门。

3. 案件的性质与后果：

   • 行政案件主要涉及行政处罚、行政复议或行政诉讼等，其后果通常是罚款、吊销执照、责令改正等行政处罚措施。
   • 刑事案件则涉及犯罪行为的认定和刑罚的适用，其后果可能是有期徒刑、无期徒刑、罚金等刑事处罚。

4. 实际案例与判断：

   • 在实际案例中，判断一个案件是否为刑事案件，需要具体分析起诉的主体、起诉的依据以及案件的性质和后果。例如，如果某环保部门对一家企业提起诉讼，要求其停止污染行为并赔偿损失，这更可能属于行政诉讼或民事诉讼范畴；但如果该企业因污染行为构成犯罪，被公安机关立案侦查并移送检察机关起诉，那么该案件就属于刑事案件。

总结与建议：

• 当您遇到由主管部门起诉的案子时，不要急于下结论认为它就是刑事案件。而是应该仔细分析起诉的主体、依据以及案件的性质和后果。
• 如果您对案件的性质有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供详细的法律分析和建议。