结论：店家将一个订单分两次发货导致运费险不能赔付，责任归属需视具体情况而定，可能店家承担责任，也可能双方均有一定责任，甚至在某些特殊情况下消费者需承担部分责任。以下从不同角度进行分析：
店家承担责任的情况
- 合同约定角度：
- 如果在货物买卖合同中，明确约定了店家应一次性发货，且因分两次发货导致运费险不能赔付这一后果由店家承担，那么店家显然违反了合同约定，应当承担相应的责任。例如，合同中写明“卖方需一次性将订单内所有货物发出，若因分开发货导致运费险无法赔付，卖方需承担买方因此遭受的损失”。
- 店家过错角度：
- 若店家分两次发货是由于自身原因，如库存管理不善、发货流程混乱等，且这种分开发货的行为直接导致了运费险不能赔付，那么店家存在过错，应承担责任。比如，店家因为对库存数量估计错误，导致无法一次性发出订单内所有货物，从而分两次发货，最终使得运费险无法赔付，此时店家应负责。
双方均有一定责任的情况
- 合同约定不明确角度：
- 如果合同中没有明确约定发货方式是一次性还是分批次，且双方在交易过程中也没有对此进行特别说明或达成一致意见。在这种情况下，店家分两次发货可能并不构成违约，但导致运费险不能赔付这一结果，双方可能均有一定责任。例如，合同仅规定了发货时间，未提及发货次数，店家分两次发货后运费险无法赔付，此时双方可能需要协商分担损失。
- 消费者未提醒角度：
- 如果消费者在购买货物时，明知运费险的赔付规则与发货方式有关（例如，某些运费险规定一次性发货才能赔付），但未向店家明确说明自己需要一次性发货以确保运费险赔付，而店家按照常规流程分两次发货导致运费险不能赔付，那么双方可能均有一定责任。不过，这种情况下店家的责任相对较轻，因为店家可能并不知晓消费者的特殊需求。
消费者承担部分责任的情况（较为特殊）
- 消费者主动要求分开发货角度：
- 如果消费者在购买货物时，主动要求店家将一个订单分两次发货，且店家在发货前已经明确告知消费者分开发货可能会导致运费险不能赔付，但消费者仍然坚持要求分开发货。在这种情况下，消费者应承担部分或全部责任，因为消费者是导致运费险不能赔付的直接原因。
法律建议：
- 对于消费者而言，在购买货物时，应仔细阅读合同条款，特别是关于发货方式和运费险赔付的规定。如果对发货方式有特殊要求，应及时与店家沟通并明确说明，以确保自己的权益不受损害。
- 对于店家而言，应完善合同条款，明确发货方式和运费险赔付的相关规定，避免因约定不明而产生纠纷。同时，在发货前应与消费者确认发货方式，确保双方对发货方式达成一致意见。
后续行动：
- 如果双方因此产生纠纷，建议首先通过协商解决。协商不成的，可以寻求第三方调解或向法院提起诉讼。在处理纠纷时，应保留好相关证据，如合同、聊天记录、发货凭证等，以便在需要时证明自己的主张。
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